More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2119 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2119  response regulator receiver  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.567157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3508  response regulator receiver  38.6 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0793  response regulator receiver  36.67 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 246 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 246 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 246 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 246 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  33.87 
 
 		 236 aa  73.6  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0237  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2827  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5546  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.41 
 
 		 254 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335699  hitchhiker  0.0000418049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5423  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0655  response regulator  29.41 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.134395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  31.09 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  29.51 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 246 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 236 aa  70.5  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2322  two component transcriptional regulator  30.51 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4009  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597595  hitchhiker  0.0000110419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2635  response regulator receiver domain-containing protein  29.06 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0563539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1751  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.62 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4587  DNA-binding response regulator  31.36 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.93847  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.5 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1803  two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.782093  normal  0.890279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1483  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0288957  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  28.1 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1181  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 364 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.27125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  28.1 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  28.1 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.23 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2721  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  28.1 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  28.1 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  28.1 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  28.1 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  28.1 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  28.1 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  28.1 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2816  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.815193  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.75 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 237 aa  67.8  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.23 
 
 		 230 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  31.97 
 
 		 242 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  28.1 
 
 		 235 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3792  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000277452 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4725  DNA-binding response regulator  31.36 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4567  DNA-binding response regulator  31.36 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000110456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4976  DNA-binding response regulator  31.36 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5087  DNA-binding response regulator  31.36 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.23 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0272  DNA-binding response regulator  31.36 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4961  DNA-binding response regulator  31.36 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  31.97 
 
 		 242 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4948  DNA-binding response regulator  31.36 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22760  putative two-component response regulator  32.77 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4503  winged helix family two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 225 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.89 
 
 		 245 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1408  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 225 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0248977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.75 
 
 		 237 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3054  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 		 237 aa  67.4  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  33.64 
 
 		 603 aa  67  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 242 aa  67.4  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  30.89 
 
 		 231 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  35.54 
 
 		 234 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4989  DNA-binding response regulator  31.36 
 
 		 231 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1922  putative two-component response regulator  32.77 
 
 		 225 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  30.89 
 
 		 231 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 224 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2404  two component transcriptional regulator  33.9 
 
 		 255 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1561  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 226 aa  67  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0664  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 237 aa  67  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  30.51 
 
 		 270 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3584  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  35.85 
 
 		 494 aa  67  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.914816 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1512  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 226 aa  67  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2648  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4677  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.77 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2311  two component transcriptional regulator  28.93 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  30.89 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  30.89 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2704  response regulator receiver  33.33 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5728  two component transcriptional regulator  28.93 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  30.89 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.51 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  32.2 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3483  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  30.89 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1085  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0724924  normal  0.0804122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2446  two component transcriptional regulator  28.93 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.490864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2401  two component transcriptional regulator  28.93 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>