92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4474 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 292 aa  589  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  72.66 
 
 		 291 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  71.97 
 
 		 291 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  64.42 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  56.7 
 
 		 293 aa  348  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  58.87 
 
 		 317 aa  338  9e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  58.49 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  57.84 
 
 		 293 aa  335  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  62.36 
 
 		 291 aa  334  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  56.34 
 
 		 287 aa  333  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  55.33 
 
 		 294 aa  332  5e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  56.6 
 
 		 295 aa  329  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  56.23 
 
 		 295 aa  328  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  56.23 
 
 		 295 aa  328  9e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  57.78 
 
 		 295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  57.41 
 
 		 295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  61.34 
 
 		 299 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  56.83 
 
 		 404 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  56.83 
 
 		 395 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  56.47 
 
 		 486 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  56.47 
 
 		 404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  56.47 
 
 		 404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  56.47 
 
 		 404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  56.47 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  56.12 
 
 		 444 aa  318  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  53.45 
 
 		 291 aa  312  4.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  56.87 
 
 		 293 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  60.46 
 
 		 296 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  54.96 
 
 		 293 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  49.26 
 
 		 299 aa  285  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  51.74 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  47.39 
 
 		 307 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  47.06 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  47.01 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  47.01 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  47.01 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  44.93 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  46.69 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  45.9 
 
 		 307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  49.26 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  44.41 
 
 		 292 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  49.41 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  42.61 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  43.84 
 
 		 289 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  43.16 
 
 		 288 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  39.45 
 
 		 288 aa  222  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  40.96 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  43.72 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.43 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  32.94 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  33.86 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  33.07 
 
 		 293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  37.5 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  26.79 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  25.87 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  24.88 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 		 526 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  22.22 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  23.42 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  23.65 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 246 aa  52.4  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  23.37 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  26.16 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  23.74 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  24.68 
 
 		 317 aa  49.7  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  23.39 
 
 		 591 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  24.54 
 
 		 342 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  24.1 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  23.85 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  23.39 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  22.17 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  24.27 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  22.94 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  22.79 
 
 		 321 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  24.44 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  23.94 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  23.27 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  23.61 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  21.37 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  26.46 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  22.73 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  23.61 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  23.74 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  23.37 
 
 		 205 aa  43.1  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  22.82 
 
 		 444 aa  42.7  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  30.14 
 
 		 239 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  26.11 
 
 		 319 aa  42.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  25.85 
 
 		 240 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  24.35 
 
 		 306 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>