81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2350 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
291 aa  595  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  61.62 
 
 
294 aa  371  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  63.18 
 
 
404 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  63.18 
 
 
486 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  63.18 
 
 
404 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  63.18 
 
 
404 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  63.54 
 
 
395 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  63.18 
 
 
404 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  60.98 
 
 
293 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  63.18 
 
 
395 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  64.81 
 
 
299 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  63.54 
 
 
444 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  62.27 
 
 
293 aa  362  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  58.33 
 
 
295 aa  350  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  56.04 
 
 
295 aa  346  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  56.04 
 
 
295 aa  346  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  57.67 
 
 
295 aa  346  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  55.7 
 
 
295 aa  345  6e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  61.57 
 
 
291 aa  341  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  58.31 
 
 
293 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  60.67 
 
 
293 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  58.58 
 
 
296 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  51.42 
 
 
287 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  50.17 
 
 
291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  53.16 
 
 
317 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  52.79 
 
 
317 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  52.38 
 
 
307 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  52.01 
 
 
307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  50.35 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  52.01 
 
 
307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  52.01 
 
 
307 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  50.35 
 
 
299 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  49.13 
 
 
291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  53.77 
 
 
292 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  51.65 
 
 
307 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  49.65 
 
 
299 aa  299  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  46.81 
 
 
299 aa  287  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  50.37 
 
 
303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  45.3 
 
 
283 aa  259  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  43.94 
 
 
292 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  43.9 
 
 
298 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 
289 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  43.01 
 
 
293 aa  228  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  39.25 
 
 
304 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  39.01 
 
 
288 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  39.53 
 
 
293 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  38.91 
 
 
288 aa  201  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  41.22 
 
 
266 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.74 
 
 
299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  32.47 
 
 
273 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  32.84 
 
 
273 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  31.73 
 
 
293 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  34.12 
 
 
292 aa  135  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  30.04 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 
342 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  22.26 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  27.15 
 
 
318 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  31.07 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  23.91 
 
 
301 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  21.9 
 
 
299 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  23.42 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  23.85 
 
 
591 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3833  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 
344 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  26.89 
 
 
441 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  22.39 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  25.22 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  20.59 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  25.11 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  24.1 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  27.21 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  29.6 
 
 
347 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  21.62 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 
312 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1991  beta-lactamase domain-containing protein  25.15 
 
 
226 aa  43.5  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00243387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2506  metallo-beta-lactamase family protein  24.55 
 
 
228 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0097  metal-dependent hydrolase  28.89 
 
 
239 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.233639  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  23.85 
 
 
319 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  34.78 
 
 
364 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  25.6 
 
 
291 aa  42.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>