72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1322 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 293 aa  592  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  94.2 
 
 		 293 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  71.21 
 
 		 291 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  61.03 
 
 		 295 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  60.34 
 
 		 295 aa  363  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  66.18 
 
 		 299 aa  355  5.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  57.73 
 
 		 295 aa  353  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  57.73 
 
 		 295 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  57.39 
 
 		 295 aa  352  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  63.44 
 
 		 444 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  61.4 
 
 		 395 aa  351  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  59.53 
 
 		 486 aa  351  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  61.4 
 
 		 404 aa  351  7e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  63.24 
 
 		 404 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  63.24 
 
 		 404 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  63.24 
 
 		 404 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  63.24 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  59.93 
 
 		 294 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  68.56 
 
 		 296 aa  349  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  59.38 
 
 		 293 aa  346  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  60.22 
 
 		 293 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  60.74 
 
 		 291 aa  339  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  53.26 
 
 		 291 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  53.95 
 
 		 291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  52.33 
 
 		 299 aa  315  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  52 
 
 		 299 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  55.97 
 
 		 307 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  55.97 
 
 		 307 aa  310  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  55.97 
 
 		 307 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  55.97 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  51.67 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  55.6 
 
 		 307 aa  309  5e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  54.51 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  52.98 
 
 		 299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  51.89 
 
 		 287 aa  296  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  55.09 
 
 		 292 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  51.09 
 
 		 317 aa  295  4e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  52.26 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  46.05 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  46.74 
 
 		 283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  46.26 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  47.31 
 
 		 289 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  46.89 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  43.82 
 
 		 288 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  41.92 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  43.36 
 
 		 288 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  45.79 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  46.24 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  39.27 
 
 		 266 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  36.6 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  36.23 
 
 		 273 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  35.85 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  36.69 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  29.15 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  27.84 
 
 		 526 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  23.79 
 
 		 274 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  24.62 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  22.31 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 		 246 aa  50.1  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  23.16 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  25.21 
 
 		 342 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  24.09 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  24.04 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  37.14 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  24.44 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 364 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  23.26 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  30.77 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>