90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0456 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  59.93 
 
 
291 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  60.07 
 
 
317 aa  355  3.9999999999999996e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  62.41 
 
 
292 aa  352  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  59.25 
 
 
317 aa  350  1e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  61.89 
 
 
291 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  56.39 
 
 
295 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  58.15 
 
 
299 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  56.02 
 
 
295 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  53.74 
 
 
444 aa  308  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  53.74 
 
 
404 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  53.74 
 
 
404 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  53.74 
 
 
395 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  53.74 
 
 
395 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  53.74 
 
 
404 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  53.52 
 
 
486 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  53.74 
 
 
404 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  49.33 
 
 
294 aa  301  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  53.99 
 
 
293 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  55.68 
 
 
291 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  47.37 
 
 
295 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  51.02 
 
 
287 aa  296  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  49.45 
 
 
293 aa  296  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  47.37 
 
 
295 aa  295  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  46.99 
 
 
295 aa  294  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  52.85 
 
 
293 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  48.51 
 
 
293 aa  288  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  50.37 
 
 
291 aa  287  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  54.17 
 
 
296 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  44.85 
 
 
299 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  45.76 
 
 
307 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  45.76 
 
 
307 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  45.76 
 
 
307 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  45.76 
 
 
307 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  45.86 
 
 
299 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  44.11 
 
 
299 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  45.39 
 
 
307 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  44.19 
 
 
299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  43.73 
 
 
298 aa  252  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  45.28 
 
 
293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  40.93 
 
 
292 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  44.04 
 
 
289 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  41.64 
 
 
283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  41.89 
 
 
288 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  39.51 
 
 
304 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  39.01 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  41.85 
 
 
293 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.85 
 
 
299 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  39.69 
 
 
266 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  36.78 
 
 
273 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  36.02 
 
 
293 aa  185  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  36.02 
 
 
273 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  37.5 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  27.66 
 
 
302 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  24.21 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  26.9 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  29.07 
 
 
526 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  23.24 
 
 
274 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0250  beta-lactamase domain-containing protein  21.36 
 
 
246 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  26.94 
 
 
318 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  21.36 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  26.48 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  24.54 
 
 
298 aa  52.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  23.67 
 
 
246 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  25.57 
 
 
318 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  21.99 
 
 
249 aa  51.6  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0467  metallo-beta-lactamase family protein  26.36 
 
 
262 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  23.22 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  28.94 
 
 
332 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3414  Beta-lactamase  20.68 
 
 
272 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.062557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0016  beta-lactamase domain protein  25.55 
 
 
246 aa  46.2  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0887  Beta-lactamase  24.64 
 
 
261 aa  46.2  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.528185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4851  beta-lactamase domain protein  24.72 
 
 
296 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  21.61 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3580  beta-lactamase-like  23.96 
 
 
308 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  22.75 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  26.64 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0872  beta-lactamase domain protein  20.95 
 
 
209 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.172924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0203  beta-lactamase domain-containing protein  34.62 
 
 
263 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0208476  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  25.45 
 
 
342 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  25.99 
 
 
264 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  24.72 
 
 
319 aa  42.7  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  25.86 
 
 
305 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  25.59 
 
 
312 aa  42.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  26.94 
 
 
287 aa  42.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2059  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 
310 aa  42.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0322253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  26 
 
 
315 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>