83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0337 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  622  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  67.14 
 
 		 288 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  67.73 
 
 		 288 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  61.54 
 
 		 289 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  52.45 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  42.31 
 
 		 294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  41.35 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  41.35 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  41.35 
 
 		 295 aa  229  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  40.47 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  39.59 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  40.78 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  38.54 
 
 		 291 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  41.84 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  39.3 
 
 		 291 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  40.45 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  39.25 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  40.23 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  42.61 
 
 		 292 aa  222  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  42.27 
 
 		 293 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  39.72 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  41.04 
 
 		 307 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  41.92 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  41.04 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  41.04 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  41.04 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  41.04 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  38.83 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  38.06 
 
 		 293 aa  208  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  40.34 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  38.01 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  38.06 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  40.91 
 
 		 291 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  37.27 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  37 
 
 		 444 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  39.34 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.29 
 
 		 296 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  37 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  37 
 
 		 395 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  37.04 
 
 		 486 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  37.04 
 
 		 404 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  37.04 
 
 		 404 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  37.04 
 
 		 404 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  37.04 
 
 		 395 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  36.9 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  38.36 
 
 		 292 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  36.97 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  34.94 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  32.03 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  33.21 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  31.68 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  32.44 
 
 		 273 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  28.63 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  24.88 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  22.73 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  26.28 
 
 		 526 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  24.5 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  25.55 
 
 		 335 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  25.55 
 
 		 335 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  30.68 
 
 		 337 aa  49.3  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  22.63 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  22.71 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  24.24 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  22.67 
 
 		 425 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  22.95 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  23.44 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  24.38 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  24.39 
 
 		 347 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  24.24 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 		 309 aa  46.2  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  23.9 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  25.96 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  25.86 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  25.96 
 
 		 364 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  24.24 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  24.36 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  24.35 
 
 		 315 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0248  beta-lactamase domain-containing protein  21.05 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  24.06 
 
 		 477 aa  42.7  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  21.32 
 
 		 299 aa  42.4  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>