70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1032 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 291 aa  594  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  83.51 
 
 		 291 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  71.63 
 
 		 292 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  61.89 
 
 		 303 aa  342  5e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  54.06 
 
 		 293 aa  331  9e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  56.09 
 
 		 295 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  56.09 
 
 		 295 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  60.46 
 
 		 291 aa  324  9e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  59.41 
 
 		 299 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  53.93 
 
 		 295 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  53.93 
 
 		 295 aa  323  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  53.56 
 
 		 295 aa  322  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  58.58 
 
 		 287 aa  322  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  55.26 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  54.51 
 
 		 317 aa  319  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  54 
 
 		 486 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  55.68 
 
 		 404 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  54.07 
 
 		 293 aa  316  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  55.68 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  55.16 
 
 		 404 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  55.16 
 
 		 404 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  55.16 
 
 		 404 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  51.57 
 
 		 294 aa  315  5e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  55.68 
 
 		 444 aa  315  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  55.16 
 
 		 395 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  53.26 
 
 		 293 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  53.26 
 
 		 293 aa  305  6e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  60.46 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  49.13 
 
 		 291 aa  301  6.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  47.92 
 
 		 299 aa  278  5e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  47.14 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  45.86 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  46.79 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  48.07 
 
 		 283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  44.4 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  44.03 
 
 		 307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  44.03 
 
 		 307 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  44.03 
 
 		 307 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  43.66 
 
 		 307 aa  255  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  41.2 
 
 		 292 aa  242  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  44.95 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  47.06 
 
 		 293 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 		 289 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  40.93 
 
 		 288 aa  229  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  39.3 
 
 		 304 aa  225  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  36.84 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  38.62 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  41.15 
 
 		 266 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.96 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  33.07 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  32.68 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  32.3 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  32.84 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  25.98 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  26.6 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  25.09 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  25.79 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  27.67 
 
 		 526 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  23.83 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  25.4 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4202  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  23.68 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  24.06 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  27.78 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1768  hypothetical protein  26.72 
 
 		 763 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.44185  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  23.98 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  21.53 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4770  beta-lactamase domain protein  22.86 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5114  metallo-beta-lactamase family protein  25.48 
 
 		 240 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>