89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1020 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  99.32 
 
 		 295 aa  591  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  99.32 
 
 		 295 aa  591  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  76.35 
 
 		 294 aa  458  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  65.49 
 
 		 293 aa  394  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  67.79 
 
 		 293 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  59.44 
 
 		 486 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  65.93 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  59.44 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  61.43 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  61.43 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  59.44 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  61.99 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  59.44 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  59.44 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  59.93 
 
 		 295 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  60.29 
 
 		 295 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  57.73 
 
 		 293 aa  351  8e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  59.31 
 
 		 293 aa  350  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  58.52 
 
 		 291 aa  341  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  59.85 
 
 		 291 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  52.25 
 
 		 291 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  52.07 
 
 		 287 aa  326  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  52.14 
 
 		 291 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  59.85 
 
 		 296 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  53.14 
 
 		 317 aa  317  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  53.38 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  49.16 
 
 		 299 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  56.6 
 
 		 292 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  48.83 
 
 		 299 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  48.97 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  48.49 
 
 		 299 aa  309  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  49.81 
 
 		 307 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  49.81 
 
 		 307 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  49.81 
 
 		 307 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  49.81 
 
 		 307 aa  299  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  47.04 
 
 		 303 aa  296  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  48.31 
 
 		 307 aa  289  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  48.63 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  44.03 
 
 		 289 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  41.81 
 
 		 292 aa  255  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  44.81 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  40.54 
 
 		 298 aa  238  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  41.03 
 
 		 288 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  41.7 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  39.36 
 
 		 288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  41.44 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  44.18 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  37.9 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  32.45 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  32.96 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  32.34 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  31.27 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  24.63 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  24.92 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  24.79 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  25.38 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  25.44 
 
 		 526 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  24.26 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  24.6 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  23.83 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  23.43 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  24.37 
 
 		 321 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  32.97 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 339 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  21.21 
 
 		 315 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  32.26 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  22.81 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5541  beta-lactamase domain protein  23.98 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  26.59 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  24.22 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  31.96 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  30.23 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3833  beta-lactamase domain protein  23.79 
 
 		 344 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  27.36 
 
 		 335 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  27.36 
 
 		 335 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  34.48 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  23.02 
 
 		 321 aa  42.7  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  31.4 
 
 		 319 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  31.37 
 
 		 318 aa  42.7  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  25.53 
 
 		 249 aa  42.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  31.4 
 
 		 319 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 321 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>