125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3244 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 526 aa  1053    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  53.12 
 
 		 301 aa  322  7e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 		 278 aa  163  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2787  metal dependent phosphohydrolase  33.68 
 
 		 196 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3163  metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 		 201 aa  97.8  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0393  metal dependent phosphohydrolase  33.71 
 
 		 200 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1162  metal dependent phosphohydrolase  36.73 
 
 		 217 aa  85.9  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.031643  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1501  metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 		 198 aa  81.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  27.21 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0366  metal dependent phosphohydrolase  34.84 
 
 		 239 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1508  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 199 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  29.07 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0507  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  27.06 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3195  metal dependent phosphohydrolase  29.41 
 
 		 246 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7189  normal  0.125641 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05316  hypothetical protein  32.49 
 
 		 217 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 317 aa  73.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2524  HD domain-containing protein  29.41 
 
 		 218 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00879841  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 		 293 aa  72  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  26.27 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1644  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1531  metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  26.33 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  28.51 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  27.05 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0543  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2427  metal dependent phosphohydrolase  28.98 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  26.69 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2335  metal dependent phosphohydrolase  33.8 
 
 		 212 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 		 307 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 		 307 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 293 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  26.95 
 
 		 307 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.99 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1237  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 212 aa  65.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.753462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 		 307 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  27.46 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  29.18 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2064  hypothetical protein  31.31 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0016347  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  28.29 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  26.72 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.37 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000568  metal-dependent phosphohydrolase  29.8 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1687  metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.138393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1681  hypothetical protein  31.31 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  26.04 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2194  hypothetical protein  31.31 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000183278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1223  hypothetical protein  31.31 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.239453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  27.17 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  26.69 
 
 		 295 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  26.39 
 
 		 287 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  25.98 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  27.48 
 
 		 293 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0922  hypothetical protein  30.81 
 
 		 231 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.679798  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2739  hypothetical protein  30.81 
 
 		 231 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.195671  normal  0.349969 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  27.43 
 
 		 291 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3045  metal dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581871  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7497  metal-dependent phosphohydrolase  41.58 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.32308 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2059  metal dependent phosphohydrolase, HD region  34.78 
 
 		 251 aa  60.1  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0221  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 211 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3253  hypothetical protein  41.07 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  21.61 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  25.44 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  25.44 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  25.44 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4767  metal dependent phosphohydrolase  32.52 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126983  hitchhiker  0.00228546 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2552  hypothetical protein  28.21 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.427776 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3954  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394521  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  24.91 
 
 		 283 aa  57  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  25.09 
 
 		 395 aa  57  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1126  hypothetical protein  29.21 
 
 		 231 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  25.09 
 
 		 404 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  24.91 
 
 		 486 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  25.53 
 
 		 294 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2156  hypothetical protein  29.38 
 
 		 231 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.148177 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1248  hypothetical protein  29.38 
 
 		 231 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.820142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1513  putative metal dependent phosphohydrolase  27.16 
 
 		 210 aa  56.6  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0702104  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  24.91 
 
 		 395 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  24.91 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  24.91 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  24.91 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2152  hypothetical protein  29.38 
 
 		 231 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  25.44 
 
 		 299 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3833  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 344 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4131  metal dependent phosphohydrolase, HD region  32.07 
 
 		 222 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1457  hypothetical protein  31.01 
 
 		 233 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  23.28 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3492  metal dependent phosphohydrolase  37.04 
 
 		 236 aa  52.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.866996  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2209  hypothetical protein  28.87 
 
 		 231 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.796217  normal  0.438715 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  23.08 
 
 		 292 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  21.09 
 
 		 273 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5268  metal dependent phosphohydrolase  31.09 
 
 		 225 aa  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.221886 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  20.73 
 
 		 293 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0267  metal dependent phosphohydrolase  30.07 
 
 		 214 aa  50.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>