68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2292 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  100 
 
 		 299 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  77.47 
 
 		 293 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  57.09 
 
 		 298 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  49.06 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  43.64 
 
 		 293 aa  228  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  48.19 
 
 		 295 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  47.17 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  47.79 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  43.05 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  45.85 
 
 		 444 aa  222  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  44.18 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  44.18 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  43.78 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  42.32 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  44.66 
 
 		 486 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  44.58 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  44.66 
 
 		 395 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  44.66 
 
 		 404 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  44.66 
 
 		 404 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  44.66 
 
 		 395 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  44.66 
 
 		 404 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  44.27 
 
 		 404 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  41.32 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  44 
 
 		 291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  42.21 
 
 		 317 aa  215  7e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  41.85 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  41.08 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  41.83 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  41.32 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  46.77 
 
 		 291 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  40.97 
 
 		 299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  41.96 
 
 		 291 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  44.11 
 
 		 292 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  41.22 
 
 		 287 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  45.85 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  40.68 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  39.72 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  36.49 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  38.75 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  38.75 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  47.79 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  38.46 
 
 		 288 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  37.68 
 
 		 288 aa  195  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  38.74 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  35.45 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  33.97 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  29.96 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  29.69 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  32.94 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  28.47 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  29.82 
 
 		 526 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  23.39 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  28.68 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  24.86 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  23.25 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  25.22 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  31.34 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 246 aa  45.8  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  23.53 
 
 		 326 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  21.54 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  23.35 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  24.32 
 
 		 597 aa  42.7  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>