78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1206 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1206  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
307 aa  634    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.734556  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3164  beta-lactamase domain-containing protein  99.67 
 
 
307 aa  631  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3165  beta-lactamase domain-containing protein  99.67 
 
 
307 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.808585  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3308  beta-lactamase domain-containing protein  99.35 
 
 
307 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0306529 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2783  beta-lactamase domain-containing protein  95.44 
 
 
307 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0376946  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3474  metallo-beta-lactamase family protein  79.39 
 
 
299 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1090  beta-lactamase domain-containing protein  78.97 
 
 
299 aa  485  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1156  beta-lactamase domain-containing protein  77.36 
 
 
299 aa  484  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1090  beta-lactamase domain-containing protein  78.97 
 
 
299 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3628  beta-lactamase domain protein  51.89 
 
 
293 aa  322  6e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3489  beta-lactamase domain protein  53.33 
 
 
293 aa  315  5e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.383942  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2218  Beta-lactamase-like  57.09 
 
 
291 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1322  beta-lactamase domain protein  54.11 
 
 
293 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.957782 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2350  beta-lactamase domain protein  52.22 
 
 
291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1386  beta-lactamase domain protein  55.94 
 
 
293 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3136  metallo-beta-lactamase family protein  51.82 
 
 
404 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0968  metallo-beta-lactamase family protein  49.81 
 
 
295 aa  299  5e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1020  beta-lactamase domain-containing protein  49.81 
 
 
295 aa  298  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00690  hypothetical protein  50.74 
 
 
295 aa  298  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696824  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1880  metallo-beta-lactamase family protein  51.46 
 
 
404 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3253  hypothetical protein  49.44 
 
 
295 aa  297  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0891036  hitchhiker  0.0000000147175 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3173  metallo-beta-lactamase family protein  51.46 
 
 
486 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0896  metallo-beta-lactamase family protein  51.46 
 
 
404 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.723759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2729  metallo-beta-lactamase family protein  51.46 
 
 
404 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3190  metallo-beta-lactamase family protein  51.46 
 
 
395 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0057  hypothetical protein  50.37 
 
 
295 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2018  metallo-beta-lactamase family protein  51.46 
 
 
395 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1429  metallo-beta-lactamase family protein  51.46 
 
 
444 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1754  beta-lactamase domain protein  52.77 
 
 
299 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2446  metallo-beta-lactamase superfamily protein  55.17 
 
 
296 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3840  beta-lactamase domain-containing protein  48.95 
 
 
294 aa  291  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3100  beta-lactamase domain-containing protein  47.04 
 
 
287 aa  288  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0456  beta-lactamase domain protein  45.76 
 
 
303 aa  271  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4474  Beta-lactamase-like  46.79 
 
 
292 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2043  beta-lactamase domain-containing protein  47.9 
 
 
283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493734  normal  0.574906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4421  beta-lactamase domain-containing protein  42.91 
 
 
291 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.951601  normal  0.632005 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1401  beta-lactamase domain-containing protein  44.74 
 
 
317 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0192  hypothetical protein  45.45 
 
 
292 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1032  beta-lactamase domain-containing protein  43.93 
 
 
291 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1475  hypothetical protein  44.36 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4778  beta-lactamase domain-containing protein  44.37 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140958  normal  0.142084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1097  beta-lactamase domain-containing protein  41.1 
 
 
298 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0337  hypothetical protein  41.13 
 
 
304 aa  221  9e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3038  beta-lactamase domain-containing protein  39.65 
 
 
288 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.332043 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000936  metallo-beta-lactamase family protein  38.16 
 
 
288 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00963821  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6473  beta-lactamase domain protein  39.21 
 
 
293 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1806  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 
293 aa  198  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.571191  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2292  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.75 
 
 
299 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0736  beta-lactamase domain-containing protein  33.6 
 
 
266 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0019476  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5480  beta-lactamase domain-containing protein  33.09 
 
 
273 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000722949 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0280  Zn-dependent hydrolase  33.21 
 
 
293 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0400931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4380  putative cytoplasmic protein  31.6 
 
 
273 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.466350000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2964  beta-lactamase-like  35.06 
 
 
292 aa  139  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.410641  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03565  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00280)  27.91 
 
 
302 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000315394  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0656  metal dependent phosphohydrolase  25.83 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3244  metal dependent phosphohydrolase  26.95 
 
 
526 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744931  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0655  metal dependent phosphohydrolase  22.93 
 
 
278 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0829  hypothetical protein  22.06 
 
 
291 aa  58.9  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.800499  unclonable  0.0000102654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  24.62 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5991  beta-lactamase domain-containing protein  25.13 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.144532  normal  0.0646735 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  23.7 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 
342 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  23.98 
 
 
298 aa  52.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  24.62 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  23.32 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 
325 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 
318 aa  49.3  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  22.86 
 
 
312 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3833  beta-lactamase domain protein  32.22 
 
 
344 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  25.11 
 
 
319 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  24.9 
 
 
319 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 
312 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4226  beta-lactamase-like  25.89 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.733966  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  24.22 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  24.22 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1308  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 
246 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  23.66 
 
 
318 aa  42.7  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>