More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1561 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1561  ABC transporter related  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1294  ABC transporter related  57.43 
 
 		 215 aa  238  4e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04650  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33 
 
 		 540 aa  89.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1835  ABC transporter related  36.24 
 
 		 251 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.15 
 
 		 273 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  31.18 
 
 		 518 aa  85.9  4e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  32.99 
 
 		 353 aa  85.5  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  29.3 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3870  ABC transporter related  37.5 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0110799 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0216  ABC transporter related  36.41 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  31.25 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0992  ABC transporter related  35.8 
 
 		 328 aa  81.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  31.6 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  32.29 
 
 		 358 aa  81.6  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  31.84 
 
 		 278 aa  81.3  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3796  ABC transporter related  36.25 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.91 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0330  ABC transporter related  30.81 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00533826 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  28.81 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.19 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0807  ABC transporter related  30.73 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  30.98 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0182  ABC transporter related  30.81 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.356361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0051  ABC transporter  32 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  33.12 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0860  ABC transporter related  29.5 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000637207  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  29.78 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  29.38 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1484  ABC transporter related  35.43 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  31.22 
 
 		 509 aa  79  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0092  ABC transporter related  32.95 
 
 		 282 aa  79  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  31.65 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  33.33 
 
 		 449 aa  78.2  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2035  ABC transporter related  29.51 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1764  ABC transporter related  33.15 
 
 		 248 aa  78.2  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000974865  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  36.42 
 
 		 319 aa  78.2  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4672  ABC transporter related  35.22 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.592834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.11 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.99 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1193  ATPase  33.75 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.076328  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2117  putative thiamine ABC transporter, ATP-binding protein  29.74 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  30.19 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0085  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3177  ABC transporter related  31.65 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.82 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  31.78 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  30.19 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1948  cobalt ABC transporter ATPase  30.81 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.701043  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2303  ABC transporter related  31.63 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0067  ABC transporter related  32.5 
 
 		 528 aa  76.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  32.29 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0578  ABC transporter related  30.65 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1927  ABC transporter related  29.67 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2142  ABC transporter related  34.39 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1367  ABC transporter related protein  31.29 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.052808  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  30.3 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.52 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  29.11 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  31.48 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  30.34 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  32.11 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.59 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  26.98 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  33.99 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  33.33 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1540  ABC transporter related  30.11 
 
 		 458 aa  75.5  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  30 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3488  ABC transporter related  37.5 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.841984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3402  ABC transporter related  31.63 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273251  normal  0.796609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2294  ABC transporter related  32.7 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  33.96 
 
 		 281 aa  75.1  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.38 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  31.47 
 
 		 372 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1087  ABC transporter related  40.51 
 
 		 307 aa  75.1  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.545891  normal  0.0171241 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0184  ATPase  29.52 
 
 		 255 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0560  ATPase  33.33 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.536031  normal  0.285253 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  30.93 
 
 		 244 aa  74.7  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  26.98 
 
 		 367 aa  74.7  0.0000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1467  ABC transporter related protein  30.69 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  29.81 
 
 		 641 aa  74.3  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  34.21 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  29.75 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.38 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  29.08 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0295  ABC transporter related  30.91 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.852806  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1338  ABC transporter related  27.68 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0193061  normal  0.712297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  29.61 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  30.86 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  26.94 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.12 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.34 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  29.94 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  28.04 
 
 		 564 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1272  ABC transporter related  31.87 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.98 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  27.89 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.75 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  36.09 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0540  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.55 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>