More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0182 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0182  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  493  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.356361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0330  ABC transporter related  96.86 
 
 		 255 aa  478  1e-134  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00533826 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2842  ABC transporter related protein  40.86 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0253  ABC transporter related  62.64 
 
 		 99 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0572111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0358  ABC transporter related  36.04 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.648234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  36.23 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  31.88 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  31.82 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  31.88 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  36.32 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.35 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  33 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  32.35 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0460  ABC transporter related  32.32 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3589  ABC transporter related  36.36 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0607744 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.03 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  32.79 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  35.68 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2090  ABC transporter component  33.33 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.810567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  35.68 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0402  ABC transporter-related protein  32.02 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  32.11 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  32.11 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6603  ABC transporter related protein  38.41 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1561  ABC transporter related  30.81 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07290  amino acid ABC transporter, ATP binding component  32.02 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175528  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  30.73 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4046  ABC transporter ATP-binding protein  31.31 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0116  ABC transporter-related protein  29.69 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  37.21 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0987  ABC transporter related  29.73 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  31.82 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  32.32 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.22 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0507  ABC transporter related  35.38 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1180  ABC transporter related  28.57 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179573  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46950  putative ATP-binding component of ABC transporter  31.31 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.832772  hitchhiker  0.00625095 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.26 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2390  ABC transporter related  34.85 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0784  ABC transporter related protein  30.52 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.217947  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  29.96 
 
 		 357 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3013  ABC transporter related  31 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2923  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.524102  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  35.29 
 
 		 333 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1839  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  31 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  29.22 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  31.08 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2136  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.32 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68203  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  33.86 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  32.32 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2005  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  32.32 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.545359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  33.2 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  32.32 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0775  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  32.32 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0185  ABC transporter related  32.66 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0631734 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2609  polar amino acid ABC transporter ATP-binding protein  32.32 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.647404  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0446  putative polar amino acid transport system ATP-binding protein  29.06 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641631  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2434  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.967343  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  34.32 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  35.09 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  30.81 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3333  ABC transporter related  33.87 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3758  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  31.44 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3428  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.901606  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  37.01 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3393  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2711  ABC transporter related  33.33 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  34.17 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  31.82 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0591  ABC transporter related  31.82 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2619  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  32.02 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0612  ABC transporter related  31.82 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0347  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140639  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6962  ABC transporter related  31.31 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1208  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  30.46 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  34.71 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  32.83 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.02 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0337  ABC transporter related  29.49 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1189  ABC transporter related  29.69 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1760  ABC transporter related  32.34 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  29.03 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3142  ABC transporter related protein  29.69 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1128  putative ABC transporter, ATP-binding protein  31.31 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1367  ABC transporter related  31.03 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.769758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1564  ABC transporter related  32.34 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239809  normal  0.409995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  31.2 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4021  ABC transporter-related protein  28.1 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000248641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1179  ABC transporter related  29.69 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  32.83 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2685  ABC transporter-related protein  28.1 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.480561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4152  ABC transporter related  31.71 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1918  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  31.89 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.248915  hitchhiker  0.0037294 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17671  ABC transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>