More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1294 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1294  ABC transporter related  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.471861  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1561  ABC transporter related  57.43 
 
 
203 aa  238  4e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  32.32 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1764  ABC transporter related  33 
 
 
248 aa  87  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000974865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.62 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1242  ABC transporter related protein  32.93 
 
 
518 aa  86.7  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.52 
 
 
257 aa  85.5  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0992  ABC transporter related  30.88 
 
 
328 aa  85.1  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.360926 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  29.38 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.96 
 
 
273 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.97 
 
 
253 aa  82  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  27.39 
 
 
271 aa  81.6  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  38.89 
 
 
358 aa  81.6  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.03 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.1 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.44 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0493  ABC transporter related  31.63 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.759588  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.49 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.16 
 
 
271 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  32.29 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.94 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2035  ABC transporter related  32.6 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.28 
 
 
272 aa  79  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.78 
 
 
264 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1338  ABC transporter related  32.91 
 
 
446 aa  79.3  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0193061  normal  0.712297 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1404  ABC transporter related  36.32 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  29.83 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.71 
 
 
310 aa  78.6  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1152  ABC transporter related  31.86 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  31.94 
 
 
242 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1032  ABC transporter related  32.84 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2142  ABC transporter related  36.42 
 
 
305 aa  78.6  0.00000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1061  ABC transporter related  32.84 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956591  hitchhiker  0.004638 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1349  ABC transporter related  33.72 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.11461  hitchhiker  0.0000183126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  27.87 
 
 
254 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.64 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  34.03 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1948  cobalt ABC transporter ATPase  32.31 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.701043  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0226  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.14 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0831  ABC transporter related  32.07 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1024  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  31.71 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0504961  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0057  tungstate/molybdate transport system ATP-binding protein  31.05 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.72588  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  32.29 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0560  ATPase  31.64 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.536031  normal  0.285253 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  32.3 
 
 
641 aa  77  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.04 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.63 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl152  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.17 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1960  ABC transporter related  35.02 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000146397  hitchhiker  0.00000000000000983668 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  31 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  34.03 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.99 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1046  ABC transporter related  29.78 
 
 
564 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.64 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4068  ABC transporter related  35.44 
 
 
359 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0623  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  30.81 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.924789  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.38 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  29.35 
 
 
641 aa  75.9  0.0000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0527  ABC transporter related protein  34.68 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0715  ABC transporter related  29.47 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0092  ABC transporter related  30.99 
 
 
282 aa  75.1  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.99 
 
 
347 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1205  ABC transporter related  30.32 
 
 
275 aa  75.1  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00183606  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2799  ABC type ATPase  33.5 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.34 
 
 
274 aa  75.1  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.88 
 
 
274 aa  75.1  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  34.36 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0877  ABC transporter related  35.5 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0562  ABC transporter related  32.39 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000187622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  28.75 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2632  ABC transporter-related protein  35.52 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.014615  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3077  ABC transporter related  31.98 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.296256  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  29.44 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  33.95 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  34.68 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.84 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  30.6 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0330  ABC transporter related  30.94 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00533826 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  26.22 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4987  ABC transporter-like  34.03 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  29.26 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  30.24 
 
 
627 aa  73.9  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  30 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  28.71 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3138  ABC transporter related  31.34 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  31.19 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  28.71 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  27.44 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  29.81 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.23 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4672  ABC transporter related  38.58 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.592834 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  31.68 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2294  ABC transporter related  30.61 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0390  ABC transporter related  33.33 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.10472  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0174  cobalt transport ATP-binding protein CbiO  33.12 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  32.22 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5772  ABC transporter related  29.8 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000320033 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2617  ABC transporter related protein  31.63 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>