More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0560 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0560  ATPase  100 
 
 		 234 aa  463  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.536031  normal  0.285253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2565  ABC transporter related  63.59 
 
 		 224 aa  267  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.814062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0877  ABC transporter related  64.39 
 
 		 210 aa  260  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3746  ABC transporter related  62.44 
 
 		 217 aa  260  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.106474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1032  ABC transporter related  65.85 
 
 		 220 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1061  ABC transporter related  65.37 
 
 		 220 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956591  hitchhiker  0.004638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4987  ABC transporter-like  62.25 
 
 		 224 aa  249  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1682  ABC transporter-like protein protein  60.49 
 
 		 223 aa  242  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0098  ABC transporter ATP-binding protein  48.54 
 
 		 208 aa  201  9e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07191  ABC transporter ATP-binding protein  46.48 
 
 		 215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.30257  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07231  ABC transporter ATP-binding protein  48.54 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391704 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07391  ABC transporter ATP-binding protein  47.32 
 
 		 215 aa  198  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07211  ABC transporter ATP-binding protein  46.48 
 
 		 215 aa  198  6e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0666  ABC transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.775453  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07791  ABC transporter ATP-binding protein  49.02 
 
 		 210 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.734728  hitchhiker  0.00527786 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14231  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 210 aa  184  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1283  ATPase  46.92 
 
 		 212 aa  184  9e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1194  ATPase  50.27 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.157933  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6452  ABC(ATP-binding) family transporter: cobalt ion  41.04 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  42.57 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1750  ABC transporter related  34.84 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.465278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  33.64 
 
 		 283 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  33.64 
 
 		 283 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1272  ABC transporter related  35.2 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  34.82 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  36.97 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  34.86 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  42.27 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.42 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1801  ABC transporter related  34.26 
 
 		 501 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.59 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.43 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  42.47 
 
 		 449 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0226  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.69 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 		 627 aa  116  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.05 
 
 		 288 aa  115  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  34.53 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.82 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.75 
 
 		 293 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.91 
 
 		 280 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1701  ABC transporter related  39.72 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.39 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  37.31 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0319  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.84 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.2074000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1504  ABC transporter related  31.88 
 
 		 268 aa  112  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  35.02 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.02 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  39.38 
 
 		 337 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1087  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.66 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2289  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.3 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.38 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2248  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.3 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  37.96 
 
 		 276 aa  111  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0153  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.63 
 
 		 293 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1113499999999999e-42 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0317  ABC transporter related  36.15 
 
 		 283 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000872921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  34.85 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.38 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.63 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.38 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.63 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.168047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.38 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.91 
 
 		 280 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.63 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000645208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.91 
 
 		 280 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0624  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.84 
 
 		 274 aa  110  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.458442  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1540  ABC transporter related protein  34.22 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000346949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.91 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.91 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  31.48 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1727  ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 355 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2301  putative ABC transporter  36.61 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00300112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0171  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.63 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000671668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5165  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.63 
 
 		 293 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000192836  hitchhiker  0.000000000000102962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0193  ABC transporter related  34.1 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.58083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  38.42 
 
 		 325 aa  109  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  32.31 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.91 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  39.38 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4355  ABC transporter related  36.28 
 
 		 342 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  0.665493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0161  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.63 
 
 		 293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  37.95 
 
 		 342 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.45 
 
 		 270 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  36.76 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  35.15 
 
 		 333 aa  108  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  34.48 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  33.03 
 
 		 810 aa  108  7.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  39.23 
 
 		 319 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  36.8 
 
 		 410 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 355 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0651  ABC transporter related protein  31.53 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.15 
 
 		 293 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0875323  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 355 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 355 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 355 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  32.62 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 355 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 355 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  34.47 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24070  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.86 
 
 		 305 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.850026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>