More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0098 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0098  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
208 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07231  ABC transporter ATP-binding protein  96.63 
 
 
208 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391704 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14231  ABC transporter ATP-binding protein  59.02 
 
 
210 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07791  ABC transporter ATP-binding protein  61.46 
 
 
210 aa  255  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.734728  hitchhiker  0.00527786 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07191  ABC transporter ATP-binding protein  57.56 
 
 
215 aa  244  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.30257  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0666  ABC transporter ATP-binding protein  58.05 
 
 
215 aa  243  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.775453  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1194  ATPase  55.61 
 
 
212 aa  242  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.157933  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07211  ABC transporter ATP-binding protein  57.07 
 
 
215 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1283  ATPase  55.07 
 
 
212 aa  234  6e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07391  ABC transporter ATP-binding protein  53.17 
 
 
215 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3746  ABC transporter related  48.78 
 
 
217 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.106474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2565  ABC transporter related  48.31 
 
 
224 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.814062  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1682  ABC transporter-like protein protein  52.69 
 
 
223 aa  201  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0560  ATPase  48.54 
 
 
234 aa  201  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.536031  normal  0.285253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0877  ABC transporter related  48.78 
 
 
210 aa  198  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4987  ABC transporter-like  48.54 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1061  ABC transporter related  50.24 
 
 
220 aa  195  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956591  hitchhiker  0.004638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1032  ABC transporter related  50.24 
 
 
220 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6452  ABC(ATP-binding) family transporter: cobalt ion  35.48 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1750  ABC transporter related  38.25 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.465278  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0831  ABC transporter related protein  38.18 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1272  ABC transporter related  35.68 
 
 
224 aa  115  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
243 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  35.56 
 
 
885 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 
255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  33.33 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  35.65 
 
 
237 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  34.25 
 
 
779 aa  108  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  35.65 
 
 
237 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2622  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
470 aa  108  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  34.78 
 
 
237 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0093  amino acid ABC transporter ATPase  35.45 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  35.87 
 
 
240 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08341  ABC transporter, ATP-binding component  33.63 
 
 
237 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.119889  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  37.56 
 
 
225 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0758  ABC transporter ATP-binding protein  35.61 
 
 
242 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0679  Sigma 54 interacting domain protein  35.52 
 
 
463 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl152  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.69 
 
 
406 aa  106  2e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08101  ABC transporter, ATP-binding component  35.61 
 
 
242 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  36.5 
 
 
242 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  31.78 
 
 
345 aa  106  3e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08111  ABC transporter, ATP-binding component  35.61 
 
 
242 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  34.98 
 
 
232 aa  106  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  34.84 
 
 
287 aa  106  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6048  ABC transporter-related protein  35.94 
 
 
243 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0164038  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 
253 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  31.63 
 
 
604 aa  105  4e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  33.95 
 
 
250 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1633  ABC transporter related  38.59 
 
 
500 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0095  ABC transporter related  36.45 
 
 
451 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0829  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.56 
 
 
292 aa  105  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.773526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  34.69 
 
 
234 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  35.43 
 
 
263 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  32.16 
 
 
568 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  35.82 
 
 
244 aa  104  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  36.76 
 
 
280 aa  104  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  34.53 
 
 
246 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 
246 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  34.98 
 
 
253 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  33.18 
 
 
244 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  35.32 
 
 
241 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  34.53 
 
 
246 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  34.53 
 
 
246 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  32.73 
 
 
248 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  34.53 
 
 
246 aa  104  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0282  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
489 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.894539  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  34.62 
 
 
242 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  33.85 
 
 
286 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2892  putative phytochrome sensor protein  35 
 
 
453 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  32.88 
 
 
903 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  36.57 
 
 
283 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0121  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.06 
 
 
246 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  34.69 
 
 
509 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  34.23 
 
 
278 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.28 
 
 
568 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  35.86 
 
 
242 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0831  ABC transporter related  35.82 
 
 
249 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0857  ABC transporter related  36.16 
 
 
243 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0865  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 
336 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4174  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.73 
 
 
244 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481199  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  33.98 
 
 
246 aa  102  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  34.8 
 
 
241 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  33.33 
 
 
1090 aa  102  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  33.48 
 
 
243 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  33.48 
 
 
243 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  37.43 
 
 
218 aa  102  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  32.27 
 
 
283 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0651  ABC transporter related protein  34.87 
 
 
277 aa  102  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  32.27 
 
 
283 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  38.83 
 
 
249 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  33.5 
 
 
810 aa  102  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0319  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.63 
 
 
288 aa  102  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.2074000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  36.76 
 
 
243 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  34.08 
 
 
247 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0795  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 
336 aa  101  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.771589  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0655  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
244 aa  102  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205588  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  34.08 
 
 
246 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0688  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 
244 aa  102  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000562177  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  34.08 
 
 
247 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>