More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1256 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1256  chromosome partitioning ATPase, ParA family protein  100 
 
 		 267 aa  530  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.531802 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1003  chromosome partitioning ATPase protein-like  34.76 
 
 		 304 aa  94.7  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1247  hypothetical protein  33.19 
 
 		 300 aa  85.9  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.862412 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0765  hypothetical protein  26.98 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0961  hypothetical protein  27.62 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.56 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.44 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.44 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.53 
 
 		 407 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.14 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  35.71 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.17 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.59 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  31.74 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.69 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0972  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.13 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  29.47 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1557  hypothetical protein  25.19 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  30.46 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.81 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  28.42 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  32.57 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.44 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.4 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.15 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  30.41 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  28.57 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  35.12 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4057  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.65 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.773684 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  28.96 
 
 		 405 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.6 
 
 		 408 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.08 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.8 
 
 		 367 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  28.95 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.51 
 
 		 472 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.85 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.54 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.17 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.7 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  28.43 
 
 		 409 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1202  putative partitioning or sporulation protein  32.52 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0936  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.51 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.04 
 
 		 338 aa  54.7  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  34.05 
 
 		 305 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  30.43 
 
 		 394 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.92 
 
 		 354 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  35.76 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.89 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4519  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.95 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  31.9 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.41 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1669  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.09 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.41 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.9 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.41 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4354  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.32 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.35 
 
 		 404 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  30.15 
 
 		 408 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.41 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.75 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000739548  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4349  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.94 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4933  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.55 
 
 		 355 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295816  normal  0.267095 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  29.88 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1770  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.47 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 287 aa  53.1  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.16 
 
 		 401 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  29.32 
 
 		 408 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  27.62 
 
 		 403 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4711  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.02 
 
 		 404 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.41 
 
 		 298 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.06 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.5 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  29.94 
 
 		 399 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  29.08 
 
 		 405 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.82 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5480  plasmid partitioning protein RepA  25 
 
 		 405 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  45.65 
 
 		 365 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.65 
 
 		 397 aa  52.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 362 aa  52.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4907  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.78 
 
 		 290 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.88 
 
 		 256 aa  52.4  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.22 
 
 		 257 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332666  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.92 
 
 		 383 aa  52.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4023  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29 
 
 		 395 aa  52.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.03067  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4928  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30 
 
 		 283 aa  52  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  29.56 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.56 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4216  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.65 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.22 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.56 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15220  chromosome partitioning ATPase  30.63 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0209681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  31.25 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.76 
 
 		 387 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0183  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.59 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150447  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.93 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.56 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>