More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1247 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1247  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  619  1e-176  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.862412 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1557  hypothetical protein  48.15 
 
 		 304 aa  309  4e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0765  hypothetical protein  46.53 
 
 		 304 aa  294  2e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0585  hypothetical protein  43.78 
 
 		 202 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.138888  normal  0.483331 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1256  chromosome partitioning ATPase, ParA family protein  33.19 
 
 		 267 aa  85.9  8e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.531802 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4519  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.51 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.49 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3966  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.86 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.87 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  26.61 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1770  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.39 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.5 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  29.17 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3751  chromosome segregation ATPase  34.53 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626525  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  30.18 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  30.63 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  29.34 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.63 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.04 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  30.63 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.63 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  30.63 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.59 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.63 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.18 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30.63 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4955  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.08 
 
 		 383 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.59 
 
 		 263 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  31.36 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  26.79 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 256 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.34 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.37 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30 
 
 		 480 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3903  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.38 
 
 		 263 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.17 
 
 		 212 aa  52.4  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  26.9 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1128  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.32 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.433779  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3649  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.81 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0570  hypothetical protein  34.52 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  28.4 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  30.59 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.12 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  27.06 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  30 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  23.89 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.56 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15550  chromosome partitioning ATPase  25.15 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4216  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.12 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.18 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.51 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.45 
 
 		 252 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  29.38 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  26.34 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.14 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.81 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32 
 
 		 350 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7432  putative partition protein  50 
 
 		 212 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.529714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.95 
 
 		 262 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.95 
 
 		 262 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.95 
 
 		 262 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.5 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3653  ParA family protein  27.98 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.109435  hitchhiker  0.0000954297 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 217 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  45.65 
 
 		 217 aa  49.7  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  47.83 
 
 		 237 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  24.78 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1003  chromosome partitioning ATPase protein-like  45.88 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 217 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.14 
 
 		 249 aa  49.3  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.15 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.91 
 
 		 337 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.54 
 
 		 262 aa  49.3  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.74 
 
 		 263 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4840  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.71 
 
 		 337 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3592  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.161207  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.45 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  25.46 
 
 		 262 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.35 
 
 		 279 aa  49.3  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.34 
 
 		 249 aa  48.9  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.34 
 
 		 367 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3286  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.37 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  25.63 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.35 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.12 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  27.81 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1176  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.99 
 
 		 254 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  35.38 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.89 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  36.47 
 
 		 218 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.12 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.14 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.83 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  27.98 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  32.94 
 
 		 222 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.54 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.29 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3918  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.89 
 
 		 401 aa  47.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.54 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.78 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>