45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1003 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1003  chromosome partitioning ATPase protein-like  100 
 
 
304 aa  609  1e-173  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0961  hypothetical protein  31.69 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1256  chromosome partitioning ATPase, ParA family protein  29.43 
 
 
267 aa  96.7  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.531802 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.99 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3714  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.19 
 
 
281 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  25.45 
 
 
258 aa  52.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0765  hypothetical protein  25.45 
 
 
304 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.78 
 
 
350 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4907  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.63 
 
 
290 aa  49.7  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1247  hypothetical protein  45.88 
 
 
300 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.862412 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.44 
 
 
313 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1557  hypothetical protein  27.68 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.92 
 
 
340 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22160  chromosome partitioning ATPase  26.47 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.57 
 
 
277 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0721  chromosome partitioning ATPase  28.71 
 
 
238 aa  45.8  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15550  chromosome partitioning ATPase  26.34 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011779  BbuZS7_G08  stage 0 sporulation protein J  24.34 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.0000611583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0095  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.27 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0058  putative ParA chromosome partitioning protein  24.18 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3067  septum site-determining protein MinD  29.84 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.95 
 
 
146 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.2409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  23.5 
 
 
279 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  25.62 
 
 
412 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0435  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.52 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7172  plasmid partitioning protein RepA  26.78 
 
 
398 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.38 
 
 
395 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.47 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933483  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5321  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.68 
 
 
301 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5246  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.68 
 
 
299 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.84 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0223  putative regulatory protein  32.43 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002182  TCA06  virulence plasmid ParA family protein pGP5-D  29.24 
 
 
268 aa  43.5  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1282  ATP-binding protein  24.74 
 
 
297 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.240384  normal  0.0376424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.89 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  24.89 
 
 
408 aa  43.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  26.46 
 
 
389 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.89 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.17 
 
 
256 aa  43.1  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0991  ATPase domain-containing protein  37.93 
 
 
360 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.440755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0670  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.31 
 
 
300 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.06 
 
 
281 aa  42.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00367255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.62 
 
 
330 aa  42.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0987  partition protein, ParA-like  37.31 
 
 
299 aa  42.4  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.000325119  n/a   
 
 
-
 
NC_011781  BbuZS7_H08  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  39.22 
 
 
251 aa  42.4  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.129369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>