More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1770 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1770  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
297 aa  610  9.999999999999999e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.41 
 
 
293 aa  316  4e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0463481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1577  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  56.18 
 
 
266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.788372 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0959  chromosome partitioning ATPase protein-like  34.94 
 
 
257 aa  169  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0109668  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4230  chromosome segregation ATPase  29.01 
 
 
266 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.096777  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  34.34 
 
 
348 aa  146  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  29.73 
 
 
258 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  29.83 
 
 
262 aa  138  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.53 
 
 
261 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  29.83 
 
 
257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1728  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.4 
 
 
273 aa  136  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.9 
 
 
266 aa  136  5e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.32 
 
 
367 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  36.41 
 
 
256 aa  133  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.3 
 
 
254 aa  133  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  39.15 
 
 
259 aa  132  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  39.27 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.41 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.74 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.94 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.14 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  36.55 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  39.25 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.44 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.57 
 
 
253 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  33.98 
 
 
249 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.2 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0095  ParA family chromosome partitioning ATPase  37.24 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0107  ParA family chromosome partitioning ATPase  37.24 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.78 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0135  ParA family chromosome partitioning ATPase  37.24 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  37.57 
 
 
262 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  34.8 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  38.38 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.08 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.71 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  37.3 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.74 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.3 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.62 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.08 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  38.1 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.3 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  31.08 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  36.27 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  34.83 
 
 
256 aa  127  3e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.23 
 
 
262 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.31 
 
 
287 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.04 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  33.33 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  40.24 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  34.58 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.76 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  39.63 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  38.17 
 
 
262 aa  126  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  38.17 
 
 
262 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.27 
 
 
293 aa  125  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1410  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.92 
 
 
261 aa  125  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.96 
 
 
275 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  34.67 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  33.5 
 
 
255 aa  125  1e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.5 
 
 
284 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  38.92 
 
 
258 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
270 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.61 
 
 
250 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.76 
 
 
339 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.26 
 
 
256 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.2 
 
 
262 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  33.04 
 
 
262 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.63 
 
 
262 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.82 
 
 
264 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2365  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.29 
 
 
256 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.909103  normal  0.144806 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  37.84 
 
 
332 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 
302 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.24 
 
 
297 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  29.15 
 
 
294 aa  123  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.61 
 
 
262 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.1 
 
 
270 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  33.48 
 
 
264 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.3 
 
 
278 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.63 
 
 
253 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3279  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.54 
 
 
298 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3498  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.53 
 
 
303 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.975248  normal  0.228635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  38.71 
 
 
259 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.04 
 
 
262 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  27.36 
 
 
270 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  32.61 
 
 
262 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  32.61 
 
 
262 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.01 
 
 
309 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1532  SpoOJ regulator protein  38.17 
 
 
260 aa  123  5e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 
255 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.04 
 
 
262 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  32.61 
 
 
262 aa  122  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.04 
 
 
262 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.14 
 
 
259 aa  122  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.04 
 
 
262 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.95 
 
 
279 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457165  normal  0.438059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>