More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1542 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
293 aa  595  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0463481  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1770  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.83 
 
 
297 aa  331  7.000000000000001e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1577  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  58.3 
 
 
266 aa  292  4e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.788372 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0959  chromosome partitioning ATPase protein-like  35.46 
 
 
257 aa  175  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0109668  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4230  chromosome segregation ATPase  34.29 
 
 
266 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.096777  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  34.15 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.34 
 
 
266 aa  144  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0277  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.69 
 
 
254 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.287869  normal  0.696383 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  32.73 
 
 
258 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2365  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.07 
 
 
256 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.909103  normal  0.144806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  32.28 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  31.36 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.86 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.11 
 
 
253 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.64 
 
 
254 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.787744  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.47 
 
 
254 aa  136  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  30.53 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.36 
 
 
255 aa  135  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.58 
 
 
255 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.68 
 
 
300 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  32 
 
 
253 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4428  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.87 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0692363  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.04 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.56 
 
 
261 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  30.82 
 
 
256 aa  133  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  30.25 
 
 
249 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  31.67 
 
 
279 aa  133  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  29.86 
 
 
257 aa  133  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.28 
 
 
255 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.83 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  31.07 
 
 
254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0066  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.1 
 
 
254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.808609 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.37 
 
 
253 aa  132  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.58 
 
 
256 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.94 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0680  sporulation initiation inhibitor protein soj  30.36 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.411466  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.64 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.23 
 
 
267 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.25 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.64 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.75 
 
 
329 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.86 
 
 
322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.77 
 
 
326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00797726  normal  0.771866 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.18 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  30.9 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  31.8 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.15 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.1 
 
 
253 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0113  chromosome segregation ATPase  38.15 
 
 
256 aa  129  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  31.34 
 
 
262 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.27 
 
 
307 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  30.77 
 
 
263 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  38.5 
 
 
253 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.8 
 
 
329 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.5 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.5 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  38.5 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.77 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.04 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.5 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.5 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.5 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0915  cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.2 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412343  normal  0.210733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  32.51 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.5 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.5 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.99 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.69 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  30.99 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.08 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.02 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  39.49 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.6 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  30.85 
 
 
293 aa  126  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2335  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.99 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000329559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.67 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.92 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.64 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.9 
 
 
253 aa  126  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  31.69 
 
 
257 aa  126  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 
264 aa  126  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0202  chromosome segregation ATPase  30.1 
 
 
259 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.09 
 
 
339 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.76 
 
 
262 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.49 
 
 
367 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.82 
 
 
257 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  39.44 
 
 
261 aa  125  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.78 
 
 
261 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
261 aa  125  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.78 
 
 
261 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00431  chromosome partitioning ATPase  29.33 
 
 
257 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.11 
 
 
262 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.43 
 
 
253 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  30.88 
 
 
257 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  30.22 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.8 
 
 
314 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.99 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.12 
 
 
270 aa  125  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1728  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.77 
 
 
273 aa  125  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>