More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0927 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2932  amidase  87.1 
 
 		 567 aa  1006    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2760  amidase  87.28 
 
 		 567 aa  1008    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0888  amidase  84.63 
 
 		 568 aa  976    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0058  amidase  70.42 
 
 		 576 aa  756    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2840  amidase  87.46 
 
 		 567 aa  991    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845019  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1657  amidase  90.99 
 
 		 567 aa  1030    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.91372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3131  amidase  84.28 
 
 		 568 aa  975    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2522  amidase  88.52 
 
 		 567 aa  1000    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1233  amidase  83.92 
 
 		 568 aa  976    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000250481 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5239  amidase  72.37 
 
 		 572 aa  766    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.065566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3257  amidase  88.52 
 
 		 570 aa  1019    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0927  amidase  100 
 
 		 569 aa  1135    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0680  Amidase  63.18 
 
 		 595 aa  712    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.914724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3140  amidase  83.92 
 
 		 568 aa  970    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.286166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5531  amidase  72.37 
 
 		 572 aa  764    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.295161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5150  amidase  72.37 
 
 		 572 aa  766    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3079  amidase  88.69 
 
 		 567 aa  1019    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3287  amidase  85.16 
 
 		 568 aa  984    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0660  amidase  84.81 
 
 		 568 aa  982    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1616  amidase  82.51 
 
 		 569 aa  958    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10040  amidase  98.76 
 
 		 569 aa  1118    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00301726  normal  0.910532 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2761  amidase  83.75 
 
 		 584 aa  971    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3283  amidase  84.63 
 
 		 584 aa  978    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3464  amidase  84.81 
 
 		 568 aa  980    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3247  amidase  65.77 
 
 		 675 aa  615  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  30 
 
 		 530 aa  194  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  29.86 
 
 		 526 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  30.46 
 
 		 481 aa  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  29.81 
 
 		 499 aa  150  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  27.12 
 
 		 491 aa  148  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  27.05 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  26.4 
 
 		 491 aa  146  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  26.42 
 
 		 491 aa  146  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  26.42 
 
 		 491 aa  146  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  26.03 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  31.02 
 
 		 559 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  26.38 
 
 		 491 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  26.38 
 
 		 491 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  28.97 
 
 		 509 aa  144  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  26.25 
 
 		 491 aa  144  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  26.93 
 
 		 491 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  27.02 
 
 		 540 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  27.52 
 
 		 488 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  28.06 
 
 		 506 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  29.17 
 
 		 536 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  29.5 
 
 		 574 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  30 
 
 		 566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  27 
 
 		 544 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4089  Amidase  31.9 
 
 		 497 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.447444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  33.24 
 
 		 519 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  27.24 
 
 		 477 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1364  amidase  29.39 
 
 		 527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.085889  normal  0.210091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  27.19 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  27.8 
 
 		 540 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.76 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  34.87 
 
 		 519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  27.54 
 
 		 459 aa  115  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1564  Amidase  29.57 
 
 		 527 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  26.2 
 
 		 472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  33.45 
 
 		 469 aa  114  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1019  amidase  27.35 
 
 		 610 aa  113  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.37 
 
 		 463 aa  113  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  29.74 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1318  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.38 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  23.64 
 
 		 486 aa  112  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  24.47 
 
 		 536 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  35.74 
 
 		 494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  31.05 
 
 		 581 aa  111  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  35.74 
 
 		 494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2226  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.52 
 
 		 491 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0279752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  35.74 
 
 		 494 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.24 
 
 		 486 aa  110  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.62 
 
 		 494 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  35.86 
 
 		 494 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2838  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.4 
 
 		 501 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2489  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.36 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.111465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  25.04 
 
 		 536 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.17 
 
 		 493 aa  109  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.810516 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.33 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2332  amidase  34.73 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13196  amidase  40.69 
 
 		 495 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.471153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3926  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.92 
 
 		 494 aa  109  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  35.46 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.58 
 
 		 484 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  36.67 
 
 		 463 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  35.46 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  36.44 
 
 		 526 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1337  indole acetimide hydrolase  35.63 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000844127 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.54 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05965  amidase  26.91 
 
 		 542 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2005  amidase  34.84 
 
 		 533 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  34.94 
 
 		 494 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  34.03 
 
 		 534 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  33.81 
 
 		 475 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  37.8 
 
 		 447 aa  107  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 		 485 aa  107  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0605  allophanate hydrolase  39.39 
 
 		 589 aa  107  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  23.34 
 
 		 536 aa  107  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  38.29 
 
 		 473 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.63 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>