More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10040 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2932  amidase  87.46 
 
 
567 aa  1011    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3140  amidase  84.45 
 
 
568 aa  979    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.286166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0888  amidase  84.81 
 
 
568 aa  978    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0680  Amidase  63.88 
 
 
595 aa  718    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.914724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1233  amidase  84.28 
 
 
568 aa  979    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000250481 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3131  amidase  84.45 
 
 
568 aa  977    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3257  amidase  89.08 
 
 
570 aa  1030    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3079  amidase  89.05 
 
 
567 aa  1023    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1657  amidase  91.53 
 
 
567 aa  1038    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.91372  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5531  amidase  72.01 
 
 
572 aa  763    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.295161 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3283  amidase  84.81 
 
 
584 aa  979    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2761  amidase  84.1 
 
 
584 aa  978    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2760  amidase  87.63 
 
 
567 aa  1014    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0058  amidase  70.77 
 
 
576 aa  759    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2840  amidase  87.81 
 
 
567 aa  998    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845019  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5150  amidase  72.01 
 
 
572 aa  766    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3287  amidase  85.04 
 
 
568 aa  988    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0660  amidase  84.68 
 
 
568 aa  985    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1616  amidase  82.6 
 
 
569 aa  966    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10040  amidase  100 
 
 
569 aa  1137    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00301726  normal  0.910532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0927  amidase  98.76 
 
 
569 aa  1118    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3464  amidase  84.68 
 
 
568 aa  984    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2522  amidase  88.71 
 
 
567 aa  1006    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5239  amidase  72.01 
 
 
572 aa  766    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.065566  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3247  amidase  65.59 
 
 
675 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  30.35 
 
 
530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  30.21 
 
 
526 aa  178  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  30.86 
 
 
481 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  27.29 
 
 
491 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  27.23 
 
 
491 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  29.81 
 
 
499 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  26.77 
 
 
491 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  26.77 
 
 
491 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  26.57 
 
 
491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  26.21 
 
 
491 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  26.55 
 
 
491 aa  148  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  31.13 
 
 
559 aa  148  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  26.55 
 
 
491 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  26.6 
 
 
491 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  28.97 
 
 
509 aa  147  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  27.1 
 
 
491 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  27.86 
 
 
488 aa  143  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  27.24 
 
 
540 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  29.17 
 
 
536 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  30.09 
 
 
574 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  30.17 
 
 
566 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  27.71 
 
 
506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  28.47 
 
 
519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4089  Amidase  32.08 
 
 
497 aa  130  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.447444 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  27.18 
 
 
544 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  27.89 
 
 
477 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1364  amidase  29.39 
 
 
527 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.085889  normal  0.210091 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  27.19 
 
 
475 aa  121  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.06 
 
 
491 aa  120  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  27.97 
 
 
540 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  34.87 
 
 
519 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  27.54 
 
 
459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1564  Amidase  29.57 
 
 
527 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145247  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  33.45 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  26.48 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.37 
 
 
463 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  30.03 
 
 
549 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  31.37 
 
 
581 aa  114  7.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2489  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.95 
 
 
490 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.111465  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2332  amidase  35.56 
 
 
542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.33 
 
 
491 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2226  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.52 
 
 
491 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0279752  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1318  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.09 
 
 
516 aa  111  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  24.3 
 
 
536 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1019  amidase  26.87 
 
 
610 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46113  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.02 
 
 
485 aa  110  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  35.34 
 
 
494 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  34.87 
 
 
534 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  35.34 
 
 
494 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  35.34 
 
 
494 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.74 
 
 
493 aa  110  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.810516 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2838  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.4 
 
 
501 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.58 
 
 
484 aa  110  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.24 
 
 
486 aa  110  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13196  amidase  40.2 
 
 
495 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.471153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  35.46 
 
 
494 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  23.47 
 
 
486 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3926  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.67 
 
 
494 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236708  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.27 
 
 
494 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  35.48 
 
 
447 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0328  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.07 
 
 
495 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1337  indole acetimide hydrolase  35.63 
 
 
510 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000844127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  38.74 
 
 
473 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  24.87 
 
 
536 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  35.89 
 
 
461 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  34.29 
 
 
475 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  36.67 
 
 
463 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4396  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.79 
 
 
495 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.366889  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  35.06 
 
 
494 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  23.26 
 
 
536 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10590  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.71 
 
 
503 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.701412  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  35.06 
 
 
494 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  34.51 
 
 
456 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3647  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.17 
 
 
493 aa  107  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  34.54 
 
 
494 aa  107  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>