More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5150 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2932  amidase  67.89 
 
 		 567 aa  764    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0888  amidase  67.13 
 
 		 568 aa  754    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0058  amidase  74.87 
 
 		 576 aa  824    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2761  amidase  66.96 
 
 		 584 aa  757    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3257  amidase  69.46 
 
 		 570 aa  780    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3079  amidase  67.71 
 
 		 567 aa  762    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3140  amidase  66.43 
 
 		 568 aa  749    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.286166  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2760  amidase  67.89 
 
 		 567 aa  767    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3131  amidase  66.43 
 
 		 568 aa  746    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2840  amidase  67.54 
 
 		 567 aa  743    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845019  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1233  amidase  66.61 
 
 		 568 aa  748    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000250481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3283  amidase  66.78 
 
 		 584 aa  749    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5150  amidase  100 
 
 		 572 aa  1129    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0927  amidase  72.55 
 
 		 569 aa  766    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5531  amidase  98.78 
 
 		 572 aa  1112    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.295161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3287  amidase  67.36 
 
 		 568 aa  759    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0660  amidase  67.36 
 
 		 568 aa  761    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1616  amidase  66.32 
 
 		 569 aa  748    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10040  amidase  72.25 
 
 		 569 aa  766    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00301726  normal  0.910532 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3464  amidase  67.36 
 
 		 568 aa  759    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2522  amidase  68.06 
 
 		 567 aa  754    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5239  amidase  100 
 
 		 572 aa  1129    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.065566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1657  amidase  69.46 
 
 		 567 aa  771    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.91372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0680  Amidase  66.61 
 
 		 595 aa  745    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.914724  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3247  amidase  59.71 
 
 		 675 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  29.9 
 
 		 526 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  31.28 
 
 		 481 aa  172  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  30.16 
 
 		 509 aa  159  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  32.36 
 
 		 530 aa  150  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  30.24 
 
 		 566 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  29.69 
 
 		 499 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  29.17 
 
 		 559 aa  130  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  36.21 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  26.26 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  36.21 
 
 		 491 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  36.64 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  36.64 
 
 		 491 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  28.89 
 
 		 536 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  34.96 
 
 		 491 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  34.96 
 
 		 491 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  27.7 
 
 		 475 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  29.05 
 
 		 526 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  26.42 
 
 		 519 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  35.78 
 
 		 491 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  35.5 
 
 		 491 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  34.2 
 
 		 491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  34.91 
 
 		 491 aa  120  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1364  amidase  30.32 
 
 		 527 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.085889  normal  0.210091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  27.83 
 
 		 506 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.55 
 
 		 491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1564  Amidase  30.13 
 
 		 527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  28.92 
 
 		 574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  36.29 
 
 		 540 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4089  Amidase  30.95 
 
 		 497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.447444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1019  amidase  28.01 
 
 		 610 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3418  amidase  22.65 
 
 		 536 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2754  Amidase  28.55 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.518277 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  31.33 
 
 		 581 aa  106  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  31.6 
 
 		 536 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  32.08 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  37.93 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  32.93 
 
 		 519 aa  105  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13196  amidase  39.15 
 
 		 495 aa  105  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.471153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  33.47 
 
 		 469 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  31.2 
 
 		 536 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  31.23 
 
 		 540 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1782  amidase  31.2 
 
 		 536 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  30.8 
 
 		 536 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1921  amidase  31.2 
 
 		 536 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.246226  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  38.5 
 
 		 472 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0616  amidase  39.11 
 
 		 547 aa  103  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  36.84 
 
 		 447 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2005  amidase  31.2 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.64 
 
 		 491 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2332  amidase  35.83 
 
 		 542 aa  101  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2226  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.73 
 
 		 491 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0279752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.47 
 
 		 494 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1761  amidase  30.8 
 
 		 536 aa  100  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2026  amidase  30 
 
 		 536 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00167874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  37.6 
 
 		 463 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  29.55 
 
 		 544 aa  99.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  35.34 
 
 		 464 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  32.79 
 
 		 494 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  32.79 
 
 		 494 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  32.11 
 
 		 494 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  32.79 
 
 		 494 aa  99  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  30.8 
 
 		 536 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  32.58 
 
 		 607 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  32.93 
 
 		 494 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  36.55 
 
 		 614 aa  98.2  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  33.33 
 
 		 494 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2562  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  31.54 
 
 		 471 aa  97.8  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  32.2 
 
 		 477 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.37 
 
 		 486 aa  97.1  9e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.55 
 
 		 495 aa  96.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  33.05 
 
 		 494 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  34.75 
 
 		 473 aa  95.1  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  35.44 
 
 		 463 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3420  amidase  28.05 
 
 		 543 aa  95.1  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  30.21 
 
 		 459 aa  95.1  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>