More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2522 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2932  amidase  86.22 
 
 
567 aa  1002    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0888  amidase  89.05 
 
 
568 aa  1028    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0680  Amidase  63.18 
 
 
595 aa  710    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.914724  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1233  amidase  87.81 
 
 
568 aa  1015    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000250481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5531  amidase  68.09 
 
 
572 aa  735    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.295161 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3257  amidase  86.42 
 
 
570 aa  1007    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5239  amidase  68.39 
 
 
572 aa  736    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.065566  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0927  amidase  88.52 
 
 
569 aa  973    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1657  amidase  91.18 
 
 
567 aa  1040    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.91372  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3140  amidase  87.81 
 
 
568 aa  1016    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.286166  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2760  amidase  86.22 
 
 
567 aa  1003    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2761  amidase  88.69 
 
 
584 aa  1026    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3131  amidase  87.99 
 
 
568 aa  1016    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0058  amidase  68.31 
 
 
576 aa  737    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5150  amidase  68.39 
 
 
572 aa  736    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3079  amidase  88.16 
 
 
567 aa  1015    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2840  amidase  86.4 
 
 
567 aa  990    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845019  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2522  amidase  100 
 
 
567 aa  1150    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3287  amidase  89.24 
 
 
568 aa  1032    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0660  amidase  89.07 
 
 
568 aa  1031    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1616  amidase  87.13 
 
 
569 aa  1008    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3283  amidase  88.16 
 
 
584 aa  1016    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10040  amidase  88.71 
 
 
569 aa  979    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00301726  normal  0.910532 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3464  amidase  89.07 
 
 
568 aa  1030    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3247  amidase  63.95 
 
 
675 aa  608  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  31.38 
 
 
530 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  33.82 
 
 
526 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  27.27 
 
 
491 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  27.27 
 
 
491 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  26.63 
 
 
491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  30.61 
 
 
559 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  26.72 
 
 
491 aa  148  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  27.07 
 
 
491 aa  148  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  26.94 
 
 
491 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  27.85 
 
 
491 aa  147  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  27.78 
 
 
506 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  27.51 
 
 
540 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  27.03 
 
 
491 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  28.04 
 
 
491 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  29.02 
 
 
499 aa  144  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  32.86 
 
 
509 aa  143  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  39.52 
 
 
481 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  29.98 
 
 
574 aa  137  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  29.14 
 
 
536 aa  136  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  37.01 
 
 
491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  28.64 
 
 
566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  26.9 
 
 
488 aa  131  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  27 
 
 
477 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4089  Amidase  30.23 
 
 
497 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.447444 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  26.87 
 
 
544 aa  125  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  26.85 
 
 
519 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.15 
 
 
491 aa  123  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1364  amidase  29.12 
 
 
527 aa  123  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.085889  normal  0.210091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3926  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.01 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236708  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0703  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.41 
 
 
487 aa  120  6e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  27.67 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  27.23 
 
 
475 aa  117  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1564  Amidase  29.12 
 
 
527 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145247  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  33.58 
 
 
469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.14 
 
 
484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1918  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.64 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.75 
 
 
500 aa  114  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.49 
 
 
491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  26 
 
 
536 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0944  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.94 
 
 
493 aa  114  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.14 
 
 
491 aa  113  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  33.76 
 
 
519 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06981  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.07 
 
 
487 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.629931  normal  0.214805 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  30.03 
 
 
549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  34.77 
 
 
526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.62 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  25.74 
 
 
536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  34.94 
 
 
540 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3660  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.47 
 
 
493 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0738  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.12 
 
 
493 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0193116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  26.1 
 
 
472 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2226  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.12 
 
 
491 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0279752  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4338  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.39 
 
 
490 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  35.34 
 
 
494 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  35.34 
 
 
494 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  35.34 
 
 
494 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1717  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.48 
 
 
493 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2332  amidase  34.6 
 
 
542 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.63 
 
 
486 aa  109  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.11 
 
 
485 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  24.02 
 
 
486 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1878  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.63 
 
 
493 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.810516 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  30.72 
 
 
581 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  34.18 
 
 
534 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13196  amidase  38.95 
 
 
495 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.471153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  33.48 
 
 
475 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  36.55 
 
 
463 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2394  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.86 
 
 
516 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.225489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  36.89 
 
 
463 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  36.12 
 
 
472 aa  107  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1521  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.62 
 
 
493 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.495498 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  24.02 
 
 
486 aa  107  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  34.54 
 
 
494 aa  107  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1333  amidase  28.02 
 
 
468 aa  106  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0479  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.74 
 
 
492 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475209  normal  0.289716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>