More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0058 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2932  amidase  70.25 
 
 
567 aa  786    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0888  amidase  66.55 
 
 
568 aa  751    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3464  amidase  66.37 
 
 
568 aa  750    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3283  amidase  66.37 
 
 
584 aa  749    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3079  amidase  70.25 
 
 
567 aa  783    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3140  amidase  66.2 
 
 
568 aa  751    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.286166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1233  amidase  66.37 
 
 
568 aa  750    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000250481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5531  amidase  74.34 
 
 
572 aa  802    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.295161 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2522  amidase  68.31 
 
 
567 aa  746    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3131  amidase  66.2 
 
 
568 aa  748    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3257  amidase  70.6 
 
 
570 aa  795    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1657  amidase  69.01 
 
 
567 aa  759    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.91372  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2760  amidase  69.89 
 
 
567 aa  784    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0927  amidase  70.42 
 
 
569 aa  744    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0058  amidase  100 
 
 
576 aa  1143    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5239  amidase  74.69 
 
 
572 aa  811    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.065566  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2840  amidase  69.37 
 
 
567 aa  761    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845019  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0680  Amidase  66.72 
 
 
595 aa  749    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.914724  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5150  amidase  74.69 
 
 
572 aa  811    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3287  amidase  66.55 
 
 
568 aa  753    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0660  amidase  66.55 
 
 
568 aa  753    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1616  amidase  66.55 
 
 
569 aa  755    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10040  amidase  70.77 
 
 
569 aa  749    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00301726  normal  0.910532 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2761  amidase  66.9 
 
 
584 aa  758    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3247  amidase  63.08 
 
 
675 aa  591  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  29.02 
 
 
530 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  29.62 
 
 
526 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  28.45 
 
 
509 aa  161  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  27.16 
 
 
491 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  27.51 
 
 
491 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  27.51 
 
 
491 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  26.72 
 
 
491 aa  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  26.63 
 
 
488 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  36.82 
 
 
491 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  26.77 
 
 
475 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  37.18 
 
 
491 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  39 
 
 
481 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  27.08 
 
 
519 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  37.5 
 
 
491 aa  136  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  28.72 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  37.39 
 
 
491 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  37.5 
 
 
491 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  25.75 
 
 
536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  30.43 
 
 
566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  25.4 
 
 
536 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2005  amidase  26.46 
 
 
533 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  25.74 
 
 
536 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  35.65 
 
 
491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  28.4 
 
 
559 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1761  amidase  25.39 
 
 
536 aa  126  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3418  amidase  24.87 
 
 
536 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  36.78 
 
 
536 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  34.14 
 
 
519 aa  122  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1782  amidase  35.66 
 
 
536 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1921  amidase  35.66 
 
 
536 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.246226  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  27 
 
 
506 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2026  amidase  35.25 
 
 
536 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00167874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1019  amidase  26.87 
 
 
610 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46113  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1364  amidase  30.12 
 
 
527 aa  117  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.085889  normal  0.210091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  34.24 
 
 
469 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  28.87 
 
 
574 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.75 
 
 
491 aa  114  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  26.52 
 
 
544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  35.1 
 
 
526 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06951  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  27.45 
 
 
592 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  26.63 
 
 
536 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3926  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.78 
 
 
494 aa  110  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236708  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  34.78 
 
 
540 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1564  Amidase  30.14 
 
 
527 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145247  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1337  indole acetimide hydrolase  27.3 
 
 
510 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000844127 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05965  amidase  31.6 
 
 
542 aa  108  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316578  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.25 
 
 
486 aa  107  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  28.61 
 
 
540 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  33.61 
 
 
494 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  33.61 
 
 
494 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1350  amidase  26.94 
 
 
446 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149618  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  33.61 
 
 
494 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0616  amidase  34.8 
 
 
547 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346122  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  29.89 
 
 
459 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1387  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.55 
 
 
467 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.593725  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  28.05 
 
 
486 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.41 
 
 
491 aa  102  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  31.27 
 
 
581 aa  101  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  30.33 
 
 
477 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  35.91 
 
 
473 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.03 
 
 
484 aa  100  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  29.18 
 
 
475 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  32.44 
 
 
456 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3252  allophanate hydrolase  31.89 
 
 
607 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.06 
 
 
494 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.02 
 
 
486 aa  100  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  32.1 
 
 
534 aa  100  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3057  amidase  27.57 
 
 
513 aa  100  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.567901  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.7 
 
 
485 aa  99.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.1 
 
 
495 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2226  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.97 
 
 
491 aa  99.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0279752  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4304  amidase  33.33 
 
 
505 aa  99  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3436  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.34 
 
 
506 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  31.36 
 
 
496 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  34.31 
 
 
463 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>