More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0680 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2932  amidase  62.29 
 
 		 567 aa  710    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3140  amidase  60.48 
 
 		 568 aa  698    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.286166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0888  amidase  60.48 
 
 		 568 aa  697    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2840  amidase  61.67 
 
 		 567 aa  697    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845019  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5531  amidase  66.84 
 
 		 572 aa  710    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.295161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5239  amidase  67.01 
 
 		 572 aa  716    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.065566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3257  amidase  63.14 
 
 		 570 aa  722    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2760  amidase  61.95 
 
 		 567 aa  708    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3131  amidase  60.03 
 
 		 568 aa  691    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3079  amidase  62.52 
 
 		 567 aa  714    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1233  amidase  59.69 
 
 		 568 aa  691    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000250481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5150  amidase  67.01 
 
 		 572 aa  716    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0680  Amidase  100 
 
 		 595 aa  1175    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.914724  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3287  amidase  60.71 
 
 		 568 aa  701    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0660  amidase  60.71 
 
 		 568 aa  703    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.396809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1616  amidase  60.31 
 
 		 569 aa  696    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3283  amidase  60.2 
 
 		 584 aa  691    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10040  amidase  63.99 
 
 		 569 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00301726  normal  0.910532 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2761  amidase  59.86 
 
 		 584 aa  694    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0058  amidase  66.72 
 
 		 576 aa  728    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0927  amidase  63.18 
 
 		 569 aa  678    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3464  amidase  60.71 
 
 		 568 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1657  amidase  63.27 
 
 		 567 aa  702    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.91372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2522  amidase  63.18 
 
 		 567 aa  695    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.458083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3247  amidase  58.51 
 
 		 675 aa  538  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  28.14 
 
 		 530 aa  153  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  30.48 
 
 		 526 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  36.31 
 
 		 481 aa  133  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  27.95 
 
 		 509 aa  127  8.000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  27.51 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  24.91 
 
 		 491 aa  122  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  32.65 
 
 		 491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1309  Amidase  29.38 
 
 		 566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  32.64 
 
 		 491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  32.64 
 
 		 491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  32.64 
 
 		 491 aa  113  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  25.61 
 
 		 519 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  32.64 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  28.07 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  31.5 
 
 		 491 aa  111  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  31.5 
 
 		 491 aa  111  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  26.94 
 
 		 544 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  29.57 
 
 		 526 aa  111  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  32.08 
 
 		 491 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.61 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  31.82 
 
 		 491 aa  109  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1364  amidase  30 
 
 		 527 aa  105  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.085889  normal  0.210091 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  33.6 
 
 		 519 aa  105  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  34.92 
 
 		 540 aa  104  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.45 
 
 		 486 aa  103  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.62 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1564  Amidase  29.7 
 
 		 527 aa  101  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.145247  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.36 
 
 		 486 aa  100  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2005  amidase  23.85 
 
 		 533 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.58 
 
 		 484 aa  99.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  23.24 
 
 		 488 aa  99.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  29.85 
 
 		 559 aa  98.6  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  28.43 
 
 		 574 aa  98.2  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  30.82 
 
 		 540 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  23.53 
 
 		 536 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4089  Amidase  39.45 
 
 		 497 aa  97.8  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.447444 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3418  amidase  23.33 
 
 		 536 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.77 
 
 		 494 aa  96.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0616  amidase  36.71 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346122  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  29.84 
 
 		 534 aa  95.9  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2489  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.42 
 
 		 490 aa  95.5  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.111465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  29.31 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  30.31 
 
 		 469 aa  95.1  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05965  amidase  29.92 
 
 		 542 aa  94.4  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316578  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5886  hypothetical protein  27.42 
 
 		 459 aa  93.6  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.371043  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.13 
 
 		 485 aa  93.2  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06951  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  25.74 
 
 		 592 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  28.57 
 
 		 536 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1019  amidase  26.48 
 
 		 610 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46113  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1782  amidase  28.57 
 
 		 536 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1337  indole acetimide hydrolase  32.95 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000844127 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1921  amidase  28.57 
 
 		 536 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.246226  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2226  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.13 
 
 		 491 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0279752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  22.48 
 
 		 536 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  24.53 
 
 		 536 aa  92  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2332  amidase  31.4 
 
 		 542 aa  91.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1761  amidase  28.19 
 
 		 536 aa  90.5  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  25 
 
 		 466 aa  90.9  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  25.89 
 
 		 581 aa  90.5  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2026  amidase  27.8 
 
 		 536 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00167874  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  33.74 
 
 		 473 aa  90.1  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.5 
 
 		 484 aa  89.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1066  Amidase  32.27 
 
 		 566 aa  90.1  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.271533  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  28.62 
 
 		 456 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0903  amidase  32.58 
 
 		 469 aa  89  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00690645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3090  allophanate hydrolase  31.02 
 
 		 614 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2754  Amidase  29.64 
 
 		 533 aa  89  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.518277 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6340  amidase  32.49 
 
 		 440 aa  88.6  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3105  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.82 
 
 		 499 aa  88.2  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  31.67 
 
 		 447 aa  87.8  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1881  amidase  25.74 
 
 		 463 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.579436  normal  0.0809644 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  30.57 
 
 		 475 aa  87.8  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4304  amidase  31.13 
 
 		 505 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3426  amidase  28.28 
 
 		 520 aa  87.4  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000155871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.65 
 
 		 491 aa  87  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>