More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_84962 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_84962  predicted protein  100 
 
 		 289 aa  576  1.0000000000000001e-163  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.536372  normal  0.854998 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  34.81 
 
 		 463 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  30.58 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1701  ribonuclease HI  28 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  35.44 
 
 		 235 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  36.46 
 
 		 192 aa  89.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3175  ribonuclease H  29.09 
 
 		 262 aa  89.7  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.983549  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  33.13 
 
 		 148 aa  89.7  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0066  putative ribonuclease HI  23.78 
 
 		 252 aa  89  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0792726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  33.13 
 
 		 148 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  34.15 
 
 		 155 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06470  RNase HI  35.58 
 
 		 150 aa  86.7  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0800016  normal  0.300256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  30.53 
 
 		 170 aa  85.9  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  35 
 
 		 148 aa  84.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4263  ribonuclease H  35.03 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000698062  hitchhiker  0.0000000000000553912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  31.9 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2115  ribonuclease H  38.06 
 
 		 146 aa  84  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.111638  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  33.33 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2183  RNase HI  33.13 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1682  ribonuclease H  27.99 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240069  unclonable  0.00000212508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  32.93 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  33.33 
 
 		 153 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  31.03 
 
 		 149 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  35.58 
 
 		 153 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  33.95 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  35.4 
 
 		 160 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2340  ribonuclease H  32.32 
 
 		 149 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1479  RNase HI  35.15 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00461786  normal  0.20485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  31.9 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1491  putative ribonuclease HI  25.09 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  33.75 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1662  Ribonuclease H  35.67 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0758  ribonuclease H  30.43 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0714  ribonuclease H  36.18 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24481  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  32.37 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1751  ribonuclease HI  40.37 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  33.95 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  33.33 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2112  Ribonuclease H  33.74 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0395213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1085  ribonuclease H  32.7 
 
 		 143 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0446  Ribonuclease H  35.44 
 
 		 145 aa  78.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  32.7 
 
 		 148 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  31.25 
 
 		 163 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2570  ribonuclease HI  32.75 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000396954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  32.35 
 
 		 157 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2151  ribonuclease HI  34.87 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  33.74 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  32.91 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  33.74 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  33.74 
 
 		 146 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  33.74 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  33.74 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  33.74 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  33.74 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  33.74 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  33.33 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  30.06 
 
 		 161 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  34.38 
 
 		 142 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  32.72 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  33.33 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  34.81 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  29.51 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  31.52 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  32.91 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  32.08 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0905  ribonuclease H  31.03 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.690877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  31.9 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  31.37 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  31.9 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1837  ribonuclease H  32.72 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000470607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  34.62 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  35.62 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2071  ribonuclease H  32.72 
 
 		 149 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  32.7 
 
 		 155 aa  75.1  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1704  ribonuclease H  32.52 
 
 		 142 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229425  normal  0.715434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  36.13 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3186  ribonuclease H  32.5 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.92 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1014  ribonuclease H  30.25 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  31.48 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  30.07 
 
 		 156 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  32.48 
 
 		 148 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1743  ribonuclease H  33.91 
 
 		 175 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  32.52 
 
 		 147 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  31.9 
 
 		 147 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27831  ribonuclease HI  35.71 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  32.48 
 
 		 148 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  31.9 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  31.9 
 
 		 147 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  31.9 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  31.9 
 
 		 147 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  32.3 
 
 		 154 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  36.21 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1593  ribonuclease H  32.53 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0204  RNase HI  31.41 
 
 		 152 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  30.82 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0297  ribonuclease HI  41.28 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  32.34 
 
 		 149 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  34.94 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1619  ribonuclease H  31.25 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>