More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1751 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1751  ribonuclease HI  100 
 
 		 278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0297  ribonuclease HI  51.23 
 
 		 361 aa  306  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0160  ribonuclease H  58.59 
 
 		 191 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47083  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  50.45 
 
 		 142 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  45.54 
 
 		 170 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  48.15 
 
 		 159 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07860  RNase HI  50 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0896  Ribonuclease H  45.97 
 
 		 358 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.317285 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09420  RNase HI  47.15 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.226214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1188  ribonuclease H  46.96 
 
 		 157 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364672  normal  0.693585 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  46.96 
 
 		 157 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  47.22 
 
 		 154 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  47.12 
 
 		 160 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  47.57 
 
 		 148 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  47.12 
 
 		 235 aa  95.5  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2340  ribonuclease H  45.63 
 
 		 149 aa  95.5  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0781  ribonuclease H  48.11 
 
 		 319 aa  95.5  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  45.37 
 
 		 157 aa  95.1  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  46.23 
 
 		 154 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  47.12 
 
 		 151 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  47.12 
 
 		 151 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1826  ribonuclease H  45.37 
 
 		 156 aa  94  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  47.12 
 
 		 175 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  47.57 
 
 		 145 aa  93.6  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2112  Ribonuclease H  43.36 
 
 		 141 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0395213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0905  ribonuclease H  44.66 
 
 		 175 aa  93.2  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.690877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  45.54 
 
 		 149 aa  93.6  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  41.88 
 
 		 166 aa  92.8  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1800  ribonuclease H  38.33 
 
 		 183 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1879  ribonuclease H  38.33 
 
 		 183 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  46 
 
 		 463 aa  92.8  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2077  ribonuclease H  37.5 
 
 		 183 aa  92.8  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498746  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  49.04 
 
 		 157 aa  92.4  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  44.66 
 
 		 149 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  47.57 
 
 		 145 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  47.12 
 
 		 154 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  44.76 
 
 		 155 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  46.6 
 
 		 527 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  43.97 
 
 		 153 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  45.71 
 
 		 153 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  44.76 
 
 		 153 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  47.62 
 
 		 151 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  47.62 
 
 		 151 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  46.15 
 
 		 154 aa  89.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  45.63 
 
 		 149 aa  89.7  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  47.62 
 
 		 154 aa  89.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  43.69 
 
 		 155 aa  89  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  45.19 
 
 		 153 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  42.72 
 
 		 161 aa  89  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  46.15 
 
 		 154 aa  89  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.63 
 
 		 532 aa  88.6  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  44.23 
 
 		 162 aa  89  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  44.66 
 
 		 145 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1662  Ribonuclease H  44.25 
 
 		 185 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1743  ribonuclease H  43.27 
 
 		 175 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  45.19 
 
 		 154 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1704  ribonuclease H  41.96 
 
 		 142 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229425  normal  0.715434 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  45.37 
 
 		 158 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  45.19 
 
 		 150 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  45.19 
 
 		 154 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  45.63 
 
 		 147 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  44.04 
 
 		 156 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1763  ribonuclease H  41.75 
 
 		 154 aa  87  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  41.88 
 
 		 161 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0424  ribonuclease H  41.75 
 
 		 154 aa  87  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.456208  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  45.63 
 
 		 148 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  46.15 
 
 		 157 aa  87  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  43.69 
 
 		 156 aa  87  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  42.11 
 
 		 158 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  41.18 
 
 		 154 aa  86.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  44.66 
 
 		 148 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  41.75 
 
 		 148 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  41.75 
 
 		 148 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0714  ribonuclease H  43.14 
 
 		 148 aa  86.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  43.52 
 
 		 155 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  43.52 
 
 		 155 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  43.52 
 
 		 155 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  43.52 
 
 		 155 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  43.52 
 
 		 155 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  45.1 
 
 		 321 aa  85.9  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  43.52 
 
 		 155 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  41.88 
 
 		 150 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  43.52 
 
 		 155 aa  85.9  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  43.52 
 
 		 155 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2939  ribonuclease H  36.89 
 
 		 163 aa  85.9  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.191934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  43.52 
 
 		 155 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  42.31 
 
 		 154 aa  85.9  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  38.74 
 
 		 153 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  42.31 
 
 		 151 aa  85.9  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  45.79 
 
 		 158 aa  85.9  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1992  ribonuclease H  44.44 
 
 		 156 aa  85.5  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000066103  hitchhiker  0.00000132763 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  44.66 
 
 		 148 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  44.66 
 
 		 148 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  44.66 
 
 		 148 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  44.66 
 
 		 146 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  44.66 
 
 		 148 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  44.66 
 
 		 148 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  44.66 
 
 		 148 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  41.96 
 
 		 158 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  41.96 
 
 		 158 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>