More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0781 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0781  ribonuclease H  100 
 
 		 319 aa  649    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0896  Ribonuclease H  65.92 
 
 		 358 aa  441  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.317285 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09420  RNase HI  53.29 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.226214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07860  RNase HI  52.57 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0297  ribonuclease HI  42.5 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8140  ribonuclease H  42.86 
 
 		 242 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0160  ribonuclease H  48.89 
 
 		 191 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47083  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2115  RNase HI  41.22 
 
 		 238 aa  109  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  43.8 
 
 		 154 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1800  ribonuclease H  42.59 
 
 		 183 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  37.67 
 
 		 149 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1879  ribonuclease H  42.59 
 
 		 183 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  41.91 
 
 		 151 aa  107  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  43.38 
 
 		 155 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  44.2 
 
 		 154 aa  106  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  43.38 
 
 		 155 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  43.38 
 
 		 155 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  43.38 
 
 		 155 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  43.38 
 
 		 155 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  43.38 
 
 		 155 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  43.38 
 
 		 155 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  43.38 
 
 		 155 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  43.38 
 
 		 155 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  40.69 
 
 		 161 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  39.86 
 
 		 150 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  41.91 
 
 		 154 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  41.91 
 
 		 154 aa  104  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0872  ribonuclease H  43.7 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  38.93 
 
 		 153 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2077  ribonuclease H  41.98 
 
 		 183 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  41.43 
 
 		 155 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  38.73 
 
 		 156 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  42.55 
 
 		 156 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0905  ribonuclease H  41.18 
 
 		 175 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.690877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2669  ribonuclease H  40.56 
 
 		 156 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0936  ribonuclease H  43.7 
 
 		 228 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0897  ribonuclease H  43.7 
 
 		 228 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  37.82 
 
 		 157 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  39.19 
 
 		 155 aa  102  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  43.7 
 
 		 155 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  41.18 
 
 		 157 aa  102  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  40.56 
 
 		 151 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  41.13 
 
 		 153 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1743  ribonuclease H  41.1 
 
 		 175 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  42.22 
 
 		 155 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  42.22 
 
 		 155 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  42.22 
 
 		 155 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  42.22 
 
 		 155 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  42.22 
 
 		 155 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  42.96 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  40.15 
 
 		 154 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1567  ribonuclease HI  36.6 
 
 		 161 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  40.15 
 
 		 154 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  40.15 
 
 		 154 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02761  ribonuclease HI  36.6 
 
 		 161 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.175549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1751  ribonuclease HI  47.41 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  39.86 
 
 		 151 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  39.19 
 
 		 175 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  39.86 
 
 		 151 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  40.82 
 
 		 154 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  42.34 
 
 		 146 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  41.67 
 
 		 148 aa  99.8  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  40.3 
 
 		 235 aa  99.8  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  35.71 
 
 		 153 aa  99.8  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0037  Ribonuclease H  40.97 
 
 		 156 aa  99.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  41.91 
 
 		 154 aa  99.4  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  39.74 
 
 		 223 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  39.16 
 
 		 151 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  39.58 
 
 		 154 aa  98.6  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4085  Ribonuclease H  42.25 
 
 		 153 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  37.41 
 
 		 148 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1101  ribonuclease H  40.13 
 
 		 245 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  39.58 
 
 		 154 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  40.44 
 
 		 155 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  37.41 
 
 		 148 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6005  ribonuclease H  41.91 
 
 		 220 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.266469  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  38.03 
 
 		 163 aa  98.2  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  38.51 
 
 		 157 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  39.58 
 
 		 162 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  39.26 
 
 		 154 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  38.85 
 
 		 159 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  37.67 
 
 		 527 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  38.46 
 
 		 151 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  40 
 
 		 154 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  39.01 
 
 		 185 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.81 
 
 		 532 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  41.61 
 
 		 160 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  38.41 
 
 		 154 aa  96.7  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2151  ribonuclease HI  39.29 
 
 		 247 aa  96.3  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  41.43 
 
 		 150 aa  96.3  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  39.86 
 
 		 166 aa  96.3  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02469  ribonuclease H  40.94 
 
 		 150 aa  95.9  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02181  ribonuclease HI  37.42 
 
 		 163 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.959518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4135  ribonuclease H  38.64 
 
 		 176 aa  95.5  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.204286  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  37.78 
 
 		 154 aa  95.9  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  36.99 
 
 		 151 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  38.97 
 
 		 147 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  39.44 
 
 		 157 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1199  ribonuclease HI  42.31 
 
 		 145 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0115399  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27831  ribonuclease HI  42.03 
 
 		 257 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>