More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1800 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1800  ribonuclease H  100 
 
 
183 aa  361  4e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1879  ribonuclease H  98.91 
 
 
183 aa  357  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2077  ribonuclease H  95.63 
 
 
183 aa  345  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1743  ribonuclease H  78.24 
 
 
175 aa  271  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0872  ribonuclease H  50 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2158  ribonuclease H  47.02 
 
 
158 aa  124  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000263424  normal  0.0842071 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2560  ribonuclease H  44.44 
 
 
158 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2235  ribonuclease H  47.02 
 
 
158 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000274591  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  44.59 
 
 
158 aa  124  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  43.33 
 
 
156 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  44.97 
 
 
153 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  45.21 
 
 
235 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  46.36 
 
 
158 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0246  ribonuclease H  40.85 
 
 
149 aa  122  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  47.95 
 
 
150 aa  121  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  45.07 
 
 
155 aa  121  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2062  ribonuclease H  45.7 
 
 
156 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  decreased coverage  0.0000999459 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2324  ribonuclease H  45.7 
 
 
156 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000039246  decreased coverage  0.0000234426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1999  ribonuclease H  45.7 
 
 
156 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2014  ribonuclease H  45.7 
 
 
156 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000135342  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03211  ribonuclease H  44.06 
 
 
154 aa  120  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  44.37 
 
 
155 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  44.37 
 
 
155 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  44.37 
 
 
155 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  47.02 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  46.05 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  44.37 
 
 
155 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  44.37 
 
 
155 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  46.15 
 
 
155 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0897  ribonuclease H  47.26 
 
 
228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0936  ribonuclease H  47.26 
 
 
228 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.234856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  45.45 
 
 
155 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  45.45 
 
 
155 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  45.45 
 
 
155 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  45.45 
 
 
155 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  45.45 
 
 
155 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  45.45 
 
 
155 aa  119  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  45.45 
 
 
155 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2399  ribonuclease H  45.45 
 
 
157 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  45.45 
 
 
155 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  46.36 
 
 
156 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  45.45 
 
 
155 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1992  ribonuclease H  40.99 
 
 
156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000066103  hitchhiker  0.00000132763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2608  ribonuclease H  42.48 
 
 
161 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000274708  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002772  ribonuclease HI  42.96 
 
 
154 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.720035  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1779  ribonuclease H  45.03 
 
 
156 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000616595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  46.94 
 
 
223 aa  117  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  41.67 
 
 
154 aa  117  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  43.66 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0262  Ribonuclease H  44.81 
 
 
158 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  43.66 
 
 
173 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08950  Ribonuclease H  41.43 
 
 
269 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  45.07 
 
 
154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  42.66 
 
 
175 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  45.21 
 
 
145 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2365  ribonuclease H  43.06 
 
 
153 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  43.97 
 
 
151 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  45.07 
 
 
154 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  42.66 
 
 
151 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  45 
 
 
154 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  42.66 
 
 
151 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  44.37 
 
 
152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  44.29 
 
 
154 aa  114  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2839  Ribonuclease H  41.55 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27831  ribonuclease HI  42.51 
 
 
257 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2115  RNase HI  43.05 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  44.16 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  44.16 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  44.16 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  44.16 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  42.57 
 
 
166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  44.87 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  44.65 
 
 
148 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  40.41 
 
 
154 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  41.26 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  44.16 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  44.16 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2205  ribonuclease H  42.86 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0167924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4085  Ribonuclease H  44.14 
 
 
153 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  45.45 
 
 
147 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  43.51 
 
 
148 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  42.25 
 
 
154 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  43.51 
 
 
148 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2778  Ribonuclease H  42.55 
 
 
153 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2690  ribonuclease H  44.14 
 
 
146 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  46.36 
 
 
146 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  45.1 
 
 
147 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  42.47 
 
 
155 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1826  ribonuclease H  40.52 
 
 
156 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0604  ribonuclease H  40.14 
 
 
154 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2019  ribonuclease H  42.25 
 
 
159 aa  111  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0600903  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  38.16 
 
 
147 aa  111  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  42.25 
 
 
154 aa  111  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  41.01 
 
 
150 aa  111  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  39.29 
 
 
527 aa  111  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  40.56 
 
 
157 aa  111  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  42.86 
 
 
151 aa  111  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  42.25 
 
 
154 aa  111  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  42.25 
 
 
154 aa  111  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  44.37 
 
 
146 aa  111  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.324706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>