More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0160 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0160  ribonuclease H  100 
 
 		 191 aa  376  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.47083  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0297  ribonuclease HI  56.16 
 
 		 361 aa  174  5e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1751  ribonuclease HI  55.94 
 
 		 278 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09420  RNase HI  43.72 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.226214 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0714  ribonuclease H  50.76 
 
 		 148 aa  117  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24481  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07860  RNase HI  51.15 
 
 		 336 aa  112  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0897  ribonuclease H  46.58 
 
 		 228 aa  110  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0936  ribonuclease H  46.58 
 
 		 228 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0872  ribonuclease H  46.53 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4895  ribonuclease H  45.65 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2653  ribonuclease H  44.85 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  0.0661742 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  43.38 
 
 		 161 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  46.32 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2077  ribonuclease H  42.94 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498746  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  45.99 
 
 		 148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1800  ribonuclease H  43.12 
 
 		 183 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1879  ribonuclease H  43.12 
 
 		 183 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  42.96 
 
 		 148 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0781  ribonuclease H  48.85 
 
 		 319 aa  107  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  41.18 
 
 		 154 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  42.96 
 
 		 148 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  45.59 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  45.59 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  45.59 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  45.59 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  45.59 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  45.59 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  45.59 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  45.59 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  43.54 
 
 		 148 aa  104  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  43.54 
 
 		 148 aa  104  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1743  ribonuclease H  43.66 
 
 		 175 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.589548 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1199  ribonuclease HI  44.85 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0115399  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  41.55 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  42.86 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  43.45 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1881  ribonuclease H  45.32 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  47.01 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  45.21 
 
 		 155 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0896  Ribonuclease H  47.69 
 
 		 358 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.317285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  43.38 
 
 		 148 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  45.26 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  43.38 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2281  ribonuclease H  42.03 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  43.84 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  42.03 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  42.03 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  42.03 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  42.03 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0593  ribonuclease H  42 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  42.03 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  42.03 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  42.03 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  41.3 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  42.03 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2340  ribonuclease H  42.65 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  42.03 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  40.71 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  42.65 
 
 		 147 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  42.65 
 
 		 147 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  42.65 
 
 		 147 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  43.06 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  42.65 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1464  ribonuclease H  41.3 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  45.27 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  42.65 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  42.45 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2112  Ribonuclease H  42.96 
 
 		 141 aa  99.8  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0395213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  42.07 
 
 		 148 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  43.48 
 
 		 153 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02469  ribonuclease H  42.86 
 
 		 150 aa  99.8  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.79431  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  40.85 
 
 		 154 aa  99  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  46.15 
 
 		 149 aa  99.4  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  41.01 
 
 		 154 aa  99.4  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  41.13 
 
 		 142 aa  99  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2366  ribonuclease H  41.84 
 
 		 158 aa  99  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704244  hitchhiker  0.00794222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  40.28 
 
 		 145 aa  98.6  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1101  ribonuclease H  44.6 
 
 		 245 aa  98.6  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  44.12 
 
 		 152 aa  98.6  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  46.27 
 
 		 223 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0844  ribonuclease H  42.96 
 
 		 150 aa  98.6  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  41.18 
 
 		 160 aa  98.2  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2274  ribonuclease H  45.99 
 
 		 156 aa  97.8  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.933446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  42.86 
 
 		 155 aa  98.2  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  40.15 
 
 		 154 aa  97.8  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0301  ribonuclease H  40.71 
 
 		 155 aa  97.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0307  ribonuclease H  40.71 
 
 		 155 aa  97.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0142891  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0286  ribonuclease H  40.71 
 
 		 155 aa  97.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0293  ribonuclease H  40.71 
 
 		 155 aa  97.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.358682  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0288  ribonuclease H  40.71 
 
 		 155 aa  97.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.170302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  39.85 
 
 		 154 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  39.85 
 
 		 154 aa  97.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  41.91 
 
 		 161 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  39.85 
 
 		 154 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2527  RNase HI  44.37 
 
 		 150 aa  97.1  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  42.65 
 
 		 150 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  41.84 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  43.48 
 
 		 148 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  40.58 
 
 		 150 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0496  ribonuclease H  40.29 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000149307  normal  0.327307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>