154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33169 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_42384  allantoin permease  82.91 
 
 
596 aa  993    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.338848  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33169  allantoin permease  100 
 
 
593 aa  1216    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0477743  normal  0.268616 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00690  uracil permease, putative  40.11 
 
 
560 aa  405  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00660  uracil transporter (Eurofung)  48.67 
 
 
478 aa  352  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0940122  normal  0.0243267 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30685  allantoin transport  31.83 
 
 
575 aa  295  1e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.22109 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11211  conserved hypothetical protein  31.12 
 
 
563 aa  276  5e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0468046  normal  0.297594 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02280  hypothetical protein  32.32 
 
 
573 aa  250  5e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104271  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08416  conserved hypothetical protein  31.42 
 
 
527 aa  249  9e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03352  uracil transporter, putative (Eurofung)  32.5 
 
 
578 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00460  allantoin permease, putative  31.14 
 
 
546 aa  238  2e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04152  conserved hypothetical protein  31.12 
 
 
483 aa  226  8e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.983602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  32.93 
 
 
507 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29465  Thiamine Metabolism  29.14 
 
 
555 aa  213  7e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  32.67 
 
 
499 aa  212  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  29.88 
 
 
497 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02550  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 
557 aa  204  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.169602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  28.92 
 
 
492 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  32.79 
 
 
494 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  28.72 
 
 
517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  30.54 
 
 
524 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07955  hypothetical transporter, cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin family (Eurofung)  28.63 
 
 
597 aa  193  6e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.214148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  30.41 
 
 
502 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  30.35 
 
 
509 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  30.26 
 
 
533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  29.59 
 
 
503 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  29.65 
 
 
503 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  29.57 
 
 
503 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  30.12 
 
 
490 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  29.66 
 
 
482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  29.57 
 
 
502 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  29.57 
 
 
502 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  30.77 
 
 
502 aa  173  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  30.55 
 
 
502 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  30.55 
 
 
502 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  30.11 
 
 
502 aa  171  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  28.78 
 
 
500 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  31.05 
 
 
502 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2210  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.11 
 
 
502 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  29.51 
 
 
496 aa  162  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.42 
 
 
494 aa  162  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.1 
 
 
489 aa  156  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.01 
 
 
485 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.28 
 
 
497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2516  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.44 
 
 
479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0734451 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.69 
 
 
516 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.49 
 
 
486 aa  144  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  27.92 
 
 
516 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1110  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.05 
 
 
494 aa  143  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.852121  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.05 
 
 
505 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.46 
 
 
516 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.46 
 
 
516 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.05 
 
 
514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49824  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  26.68 
 
 
532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  26.25 
 
 
496 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1056  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  23.81 
 
 
494 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2680  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  23.81 
 
 
494 aa  141  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0268197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  26.25 
 
 
496 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1924  NCS1 family nucleobase/cation symporter  25.95 
 
 
493 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.713736 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5280  permease  25.3 
 
 
494 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0491741 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1305  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.06 
 
 
494 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354634 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0866  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.59 
 
 
494 aa  137  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.4 
 
 
518 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.4 
 
 
518 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.65 
 
 
500 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1953  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.01 
 
 
494 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1880  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.01 
 
 
494 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.9 
 
 
543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2331  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55059 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2535  NCS1 nucleoside transporter family protein  24.68 
 
 
534 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.173195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3301  NCS1 nucleoside transporter family protein  24.68 
 
 
534 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1510  NCS1 nucleoside transporter family protein  25 
 
 
496 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2390  NCS1 nucleoside transporter family protein  25 
 
 
496 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2434  NCS1 nucleoside transporter family protein  24.68 
 
 
510 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1281  NCS1 nucleoside transporter family protein  25 
 
 
496 aa  134  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.425173  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2009  NCS1 nucleoside transporter family protein  24.68 
 
 
510 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6112  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.06 
 
 
494 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.06 
 
 
494 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  27.46 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1989  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.82 
 
 
494 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.598133  normal  0.623135 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.72 
 
 
503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.25 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1302  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.11 
 
 
498 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155408  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.79 
 
 
510 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  26.48 
 
 
517 aa  131  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.95 
 
 
490 aa  131  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.54 
 
 
497 aa  131  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  25.36 
 
 
515 aa  130  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0898  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.86 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.83 
 
 
514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  27.33 
 
 
510 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2065  NCS1 nucleoside transporter family protein  24.52 
 
 
496 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  25.15 
 
 
496 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0932  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.11 
 
 
517 aa  126  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  24.95 
 
 
496 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1778  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.77 
 
 
506 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1814  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.76 
 
 
522 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.28 
 
 
494 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0913  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.79 
 
 
486 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0656  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.19 
 
 
494 aa  125  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.871285  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.01 
 
 
483 aa  123  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>