168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM02550 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM02550  conserved hypothetical protein  100 
 
 
557 aa  1134    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.169602  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00460  allantoin permease, putative  36.87 
 
 
546 aa  344  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08416  conserved hypothetical protein  31.29 
 
 
527 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00690  uracil permease, putative  31.21 
 
 
560 aa  249  8e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03352  uracil transporter, putative (Eurofung)  28.96 
 
 
578 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07955  hypothetical transporter, cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin family (Eurofung)  28.15 
 
 
597 aa  226  6e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.214148 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11211  conserved hypothetical protein  30.68 
 
 
563 aa  224  4e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0468046  normal  0.297594 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30685  allantoin transport  29.17 
 
 
575 aa  223  6e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.22109 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29465  Thiamine Metabolism  28.19 
 
 
555 aa  216  5.9999999999999996e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  30.77 
 
 
507 aa  209  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42384  allantoin permease  29.96 
 
 
596 aa  206  6e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.338848  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04152  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 
483 aa  206  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.983602 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  28.93 
 
 
497 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33169  allantoin permease  27.34 
 
 
593 aa  203  7e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0477743  normal  0.268616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  30.11 
 
 
509 aa  200  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02280  hypothetical protein  27.4 
 
 
573 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104271  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  29.05 
 
 
492 aa  196  7e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  28.84 
 
 
517 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  30.27 
 
 
499 aa  189  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  29.19 
 
 
503 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  28.73 
 
 
503 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  30.09 
 
 
502 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  30.09 
 
 
502 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  29.35 
 
 
502 aa  187  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  29.21 
 
 
503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  29.86 
 
 
502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  29.86 
 
 
502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  29.64 
 
 
502 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  29.41 
 
 
502 aa  183  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  27.29 
 
 
494 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00660  uracil transporter (Eurofung)  31.41 
 
 
478 aa  177  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0940122  normal  0.0243267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  30.02 
 
 
490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  29.86 
 
 
502 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  27.19 
 
 
496 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.25 
 
 
494 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  27.42 
 
 
524 aa  169  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  26.77 
 
 
533 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.12 
 
 
489 aa  164  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.25 
 
 
497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  25.52 
 
 
482 aa  154  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2210  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.62 
 
 
502 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  26.07 
 
 
500 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  29.98 
 
 
496 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.75 
 
 
505 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  29.98 
 
 
496 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.56 
 
 
494 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0774  NCS1 nucleoside transporter family protein  26.01 
 
 
494 aa  150  5e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  28.79 
 
 
515 aa  150  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  30.43 
 
 
500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.44 
 
 
516 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.44 
 
 
516 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  25.23 
 
 
516 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  31.1 
 
 
496 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.22 
 
 
516 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  31.1 
 
 
496 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  25.29 
 
 
510 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.3 
 
 
510 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  25.06 
 
 
510 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.34 
 
 
510 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.11 
 
 
488 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49824  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  25.49 
 
 
532 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25 
 
 
514 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  25.99 
 
 
487 aa  137  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  26.42 
 
 
517 aa  136  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.33 
 
 
485 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.81 
 
 
522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.49 
 
 
483 aa  135  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1280  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.28 
 
 
483 aa  133  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.3 
 
 
486 aa  133  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  25.99 
 
 
487 aa  133  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.06 
 
 
503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.17 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.84 
 
 
499 aa  130  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3769  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.86 
 
 
547 aa  130  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3413  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.6 
 
 
569 aa  130  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.17 
 
 
490 aa  130  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2331  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.05 
 
 
493 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1814  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.26 
 
 
522 aa  127  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5091  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.72 
 
 
483 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415087  normal  0.0197454 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.55 
 
 
543 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5371  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.99 
 
 
484 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.583261  normal  0.663394 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2703  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.95 
 
 
492 aa  125  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0582  putative permease  25.29 
 
 
575 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.33 
 
 
518 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.33 
 
 
518 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3810  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.16 
 
 
497 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1302  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.17 
 
 
498 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155408  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1924  NCS1 family nucleobase/cation symporter  24.36 
 
 
493 aa  124  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.713736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.9 
 
 
497 aa  123  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06230  putative permease  24.82 
 
 
575 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.037417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1305  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.35 
 
 
494 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354634 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2087  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.06 
 
 
485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.611219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0611  allantoin permease  25.78 
 
 
463 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2434  NCS1 nucleoside transporter family protein  25.3 
 
 
510 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2009  NCS1 nucleoside transporter family protein  25.3 
 
 
510 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2535  NCS1 nucleoside transporter family protein  25.3 
 
 
534 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.173195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3301  NCS1 nucleoside transporter family protein  25.3 
 
 
534 aa  120  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  25.56 
 
 
484 aa  120  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5280  permease  23.58 
 
 
494 aa  120  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0491741 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3102  NCS1 nucleoside transporter family  25.34 
 
 
484 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>