156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30685 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_30685  allantoin transport  100 
 
 
575 aa  1183    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.22109 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11211  conserved hypothetical protein  44.73 
 
 
563 aa  450  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0468046  normal  0.297594 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03352  uracil transporter, putative (Eurofung)  38.15 
 
 
578 aa  399  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33169  allantoin permease  31.83 
 
 
593 aa  270  4e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0477743  normal  0.268616 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42384  allantoin permease  32.42 
 
 
596 aa  266  5.999999999999999e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.338848  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00690  uracil permease, putative  29.71 
 
 
560 aa  249  8e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29465  Thiamine Metabolism  27.27 
 
 
555 aa  229  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02280  hypothetical protein  27.56 
 
 
573 aa  226  9e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104271  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08416  conserved hypothetical protein  29.8 
 
 
527 aa  219  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00460  allantoin permease, putative  30.27 
 
 
546 aa  207  6e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04152  conserved hypothetical protein  28.23 
 
 
483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.983602 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07955  hypothetical transporter, cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin family (Eurofung)  27.71 
 
 
597 aa  194  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.214148 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02550  conserved hypothetical protein  29.29 
 
 
557 aa  193  6e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.169602  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00660  uracil transporter (Eurofung)  30.37 
 
 
478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0940122  normal  0.0243267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  27.44 
 
 
507 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  26.21 
 
 
497 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  24.64 
 
 
500 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  27.39 
 
 
492 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.88 
 
 
486 aa  154  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2516  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.18 
 
 
479 aa  154  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0734451 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  24.29 
 
 
524 aa  153  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  27.39 
 
 
517 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.39 
 
 
489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.45 
 
 
497 aa  146  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  27.58 
 
 
509 aa  146  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  25.44 
 
 
502 aa  145  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2210  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.84 
 
 
502 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0774  NCS1 nucleoside transporter family protein  25.76 
 
 
494 aa  139  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  24.62 
 
 
503 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25 
 
 
494 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  26.75 
 
 
499 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  24.56 
 
 
503 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  26.37 
 
 
490 aa  137  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.43 
 
 
483 aa  137  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.52 
 
 
503 aa  137  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  24.34 
 
 
503 aa  137  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  24.78 
 
 
502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  24.56 
 
 
502 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  24.56 
 
 
502 aa  134  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.52 
 
 
488 aa  134  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  25 
 
 
502 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0553  allantoin permease  27.88 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.962113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  24.95 
 
 
533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  27.88 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0611  allantoin permease  27.88 
 
 
463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00461  predicted allantoin transporter  27.65 
 
 
484 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.592868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3102  NCS1 nucleoside transporter family  27.65 
 
 
484 aa  131  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00466  hypothetical protein  27.65 
 
 
484 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.955616  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  24.23 
 
 
502 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3112  allantoin permease  27.65 
 
 
484 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  24.45 
 
 
502 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49824  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  25.05 
 
 
532 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  23.98 
 
 
502 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  24.45 
 
 
482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0584  allantoin permease  27.43 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.75 
 
 
490 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.89 
 
 
485 aa  128  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  25.57 
 
 
494 aa  128  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1280  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.25 
 
 
483 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0932  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.74 
 
 
517 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.64 
 
 
516 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.64 
 
 
516 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.42 
 
 
514 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5237  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.92 
 
 
543 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  25.64 
 
 
515 aa  124  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.43 
 
 
516 aa  124  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4869  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.92 
 
 
518 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4958  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.92 
 
 
518 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1814  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.61 
 
 
522 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0570  allantoin permease  27.72 
 
 
484 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  0.884181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0575  allantoin permease  27.72 
 
 
484 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.240762  normal  0.88047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0568  allantoin permease  27.72 
 
 
484 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0629  allantoin permease  27.72 
 
 
484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2764  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  24.13 
 
 
517 aa  120  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.63902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.42 
 
 
510 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  23.83 
 
 
516 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2703  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.77 
 
 
492 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.42 
 
 
494 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.89 
 
 
505 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  23.89 
 
 
496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  23.89 
 
 
496 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  24.21 
 
 
496 aa  118  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.92 
 
 
500 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5280  permease  25.17 
 
 
494 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0491741 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  25.74 
 
 
487 aa  117  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  23.56 
 
 
510 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.33 
 
 
497 aa  117  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  23.56 
 
 
510 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1305  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.29 
 
 
494 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0354634 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.75 
 
 
499 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1953  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.94 
 
 
494 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.33 
 
 
510 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1880  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.46 
 
 
494 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.67 
 
 
514 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  25.11 
 
 
496 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6112  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.68 
 
 
494 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.68 
 
 
494 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  25.53 
 
 
487 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  24.89 
 
 
496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1510  NCS1 nucleoside transporter family protein  25.87 
 
 
496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>