169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00460 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM00460  allantoin permease, putative  100 
 
 
546 aa  1100    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02550  conserved hypothetical protein  37.07 
 
 
557 aa  344  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.169602  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00690  uracil permease, putative  35.05 
 
 
560 aa  313  6.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08416  conserved hypothetical protein  35.69 
 
 
527 aa  306  7e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33169  allantoin permease  31.14 
 
 
593 aa  244  3.9999999999999997e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0477743  normal  0.268616 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29465  Thiamine Metabolism  29.23 
 
 
555 aa  243  5e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42384  allantoin permease  31.11 
 
 
596 aa  243  7e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.338848  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03352  uracil transporter, putative (Eurofung)  31.05 
 
 
578 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11211  conserved hypothetical protein  31.59 
 
 
563 aa  238  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0468046  normal  0.297594 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30685  allantoin transport  31.43 
 
 
575 aa  232  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.22109 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00660  uracil transporter (Eurofung)  33.58 
 
 
478 aa  226  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0940122  normal  0.0243267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3444  NCS1 nucleoside transporter family  32.48 
 
 
507 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000477865  normal  0.0865773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2863  NCS1 nucleoside transporter  29.34 
 
 
497 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00768  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  32.09 
 
 
499 aa  207  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02280  hypothetical protein  27.09 
 
 
573 aa  201  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104271  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2385  NCS1 nucleoside transporter family  30.43 
 
 
492 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0222  NCS1 nucleoside transporter  31.24 
 
 
509 aa  200  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1985  NCS1 nucleoside transporter family  30.43 
 
 
517 aa  200  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.671932  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1111  NCS1 nucleoside transporter  29.85 
 
 
494 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.502762  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07955  hypothetical transporter, cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin family (Eurofung)  27.4 
 
 
597 aa  189  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.214148 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0338  NCS1 nucleoside transporter  29.66 
 
 
496 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04152  conserved hypothetical protein  27.14 
 
 
483 aa  187  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.983602 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1594  NCS1 nucleoside transporter  30.37 
 
 
502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6237  NCS1 nucleoside transporter  30.37 
 
 
502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6713  NCS1 nucleoside transporter  30.17 
 
 
502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.997894 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5720  NCS1 nucleoside transporter  29.87 
 
 
502 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244182  normal  0.497544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5964  NCS1 nucleoside transporter  29.87 
 
 
502 aa  183  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0145337  normal  0.627469 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2688  NCS1 nucleoside transporter family  29.87 
 
 
503 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931856  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1430  NCS1 family nucleobase/cation symporter  29.87 
 
 
503 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4536  NCS1 nucleoside transporter family  28.81 
 
 
533 aa  180  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.854613  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1233  transporter transmembrane protein  30.08 
 
 
502 aa  179  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0759006  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1533  NCS1 nucleoside transporter  29.9 
 
 
503 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.578632  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5352  NCS1 nucleoside transporter  29.24 
 
 
502 aa  178  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.157454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3590  NCS1 nucleoside transporter  28.57 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.483466 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6657  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  29.13 
 
 
502 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.0268783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2101  NCS1 nucleoside transporter family  26.02 
 
 
500 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4150  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.03 
 
 
494 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2210  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.72 
 
 
502 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3637  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.29 
 
 
505 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0968  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.84 
 
 
489 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.553781  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2834  NCS1 nucleoside transporter  26.36 
 
 
482 aa  161  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4035  NCS1 nucleoside transporter  27.29 
 
 
496 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1803  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  27.29 
 
 
496 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666463  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49824  NCS1 family transporter: cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin  28.51 
 
 
532 aa  156  7e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05790  putative transporter  27.04 
 
 
496 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5168  NCS1 nucleoside transporter family  26.54 
 
 
524 aa  153  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0546  putative transporter  26.83 
 
 
496 aa  153  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1837  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.6 
 
 
500 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.524757  normal  0.0916284 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0774  NCS1 nucleoside transporter family protein  26.37 
 
 
494 aa  152  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0230  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.68 
 
 
486 aa  151  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.239977 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2039  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  27.13 
 
 
516 aa  150  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3440  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.25 
 
 
494 aa  150  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709152  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4056  NCS1 nucleoside transporter  28.03 
 
 
515 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4033  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.65 
 
 
497 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3875  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.09 
 
 
510 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.245681  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4309  NCS1 nucleoside transporter  27.54 
 
 
510 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747865  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4336  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.88 
 
 
516 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0269962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4030  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.88 
 
 
516 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0915622  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1756  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.19 
 
 
514 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3494  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.25 
 
 
516 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1558  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  27.69 
 
 
510 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462684  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3636  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.29 
 
 
510 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.542262  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1778  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.39 
 
 
506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00461  predicted allantoin transporter  26.14 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.592868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3102  NCS1 nucleoside transporter family  26.14 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1871  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  26.57 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3531  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.13 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0729525 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00466  hypothetical protein  26.14 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.955616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3112  allantoin permease  26.14 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0584  allantoin permease  26.14 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0570  allantoin permease  28.47 
 
 
484 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.635464  normal  0.884181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0575  allantoin permease  28.47 
 
 
484 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.240762  normal  0.88047 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0547  allantoin permease  26.14 
 
 
484 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0568  allantoin permease  28.47 
 
 
484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0629  allantoin permease  28.47 
 
 
484 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0611  allantoin permease  28 
 
 
463 aa  131  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2703  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.11 
 
 
492 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0553  allantoin permease  27.76 
 
 
484 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.962113 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.02 
 
 
522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0913  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.25 
 
 
486 aa  127  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4599  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.95 
 
 
490 aa  127  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2516  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.33 
 
 
479 aa  126  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0734451 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1836  NCS1 nucleoside transporter family protein  26.11 
 
 
487 aa  126  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.729443  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1098  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.89 
 
 
514 aa  123  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.286175  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0472  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.48 
 
 
478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0075  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.62 
 
 
485 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82012  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1908  NCS1 nucleoside transporter family protein  26.11 
 
 
487 aa  120  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.535002  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3935  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.4 
 
 
497 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1814  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.36 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4265  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.98 
 
 
503 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1280  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.67 
 
 
483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1918  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.7 
 
 
503 aa  118  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.991169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.97 
 
 
488 aa  118  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1389  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.51 
 
 
530 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.461228  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3413  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.25 
 
 
569 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0866  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.83 
 
 
494 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0335  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.77 
 
 
483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5845  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.35 
 
 
499 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149577 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2680  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  24.62 
 
 
494 aa  115  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0268197 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>