59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13582 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_13582  predicted protein  100 
 
 
79 aa  160  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  50 
 
 
479 aa  69.7  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  60.78 
 
 
952 aa  68.6  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  47.83 
 
 
466 aa  68.2  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  57.69 
 
 
611 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  60.87 
 
 
636 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  50 
 
 
636 aa  60.1  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  54.17 
 
 
635 aa  59.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  57.45 
 
 
268 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  44.12 
 
 
619 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  56.52 
 
 
632 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  55.77 
 
 
655 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  54.9 
 
 
797 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  44.12 
 
 
651 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  44.12 
 
 
622 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  56.52 
 
 
643 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  44.12 
 
 
622 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  63.04 
 
 
650 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  63.04 
 
 
650 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  45.76 
 
 
748 aa  58.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  56.52 
 
 
754 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  53.7 
 
 
2245 aa  57.8  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  51.02 
 
 
941 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  53.06 
 
 
1018 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  60 
 
 
553 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  53.7 
 
 
1077 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  50.98 
 
 
1048 aa  57  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  60 
 
 
553 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  40.91 
 
 
1999 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  58.7 
 
 
716 aa  55.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  52.94 
 
 
1090 aa  55.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  41.27 
 
 
388 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  51.06 
 
 
283 aa  52.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  53.19 
 
 
1097 aa  52.4  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  54.35 
 
 
609 aa  52  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  50.98 
 
 
633 aa  51.6  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  43.94 
 
 
1189 aa  50.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  53.33 
 
 
464 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  37.68 
 
 
795 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  55.1 
 
 
1190 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  45.1 
 
 
633 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  45.1 
 
 
633 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  45.1 
 
 
633 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  46.34 
 
 
1653 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  39.66 
 
 
2310 aa  45.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  43.94 
 
 
1038 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  41.38 
 
 
297 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  48.98 
 
 
1175 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  46.81 
 
 
1212 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  44.9 
 
 
486 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  48.72 
 
 
1585 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  48.72 
 
 
1585 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  48.94 
 
 
1427 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  45 
 
 
1185 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  46.34 
 
 
1099 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  44.23 
 
 
237 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  46.94 
 
 
752 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  48.72 
 
 
1620 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  40 
 
 
585 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>