More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12520 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12520  predicted protein  100 
 
 
434 aa  868    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94159  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30620  glucose transport protein  30.51 
 
 
515 aa  194  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  32.46 
 
 
480 aa  193  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  33.92 
 
 
492 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  30.37 
 
 
480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  32.08 
 
 
442 aa  180  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56933  General substrate transporter  28.85 
 
 
494 aa  180  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.19707  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  31.58 
 
 
477 aa  179  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  32.04 
 
 
446 aa  177  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52000  MFS family transporter: hexose  31.43 
 
 
462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128216  normal  0.0380146 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  31.35 
 
 
447 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  29.07 
 
 
450 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  30.55 
 
 
480 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  30.13 
 
 
486 aa  166  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  29.78 
 
 
544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  29.41 
 
 
504 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  29.04 
 
 
466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39560  sugar transporter, putative  27.94 
 
 
551 aa  163  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0538769 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  31.01 
 
 
468 aa  163  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  29.23 
 
 
474 aa  162  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  29.69 
 
 
478 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  31.32 
 
 
473 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  28.91 
 
 
474 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  29.06 
 
 
457 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  28.28 
 
 
444 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  31.05 
 
 
507 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  28.25 
 
 
471 aa  160  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  30.15 
 
 
487 aa  160  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  31.01 
 
 
473 aa  160  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  31.22 
 
 
463 aa  158  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  28.76 
 
 
468 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  29.15 
 
 
480 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  27.63 
 
 
533 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  31.22 
 
 
463 aa  157  3e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  31.07 
 
 
452 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  31.07 
 
 
452 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  27.39 
 
 
499 aa  156  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  29.41 
 
 
448 aa  156  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  29.25 
 
 
472 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  27.25 
 
 
561 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  28.8 
 
 
443 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  29.41 
 
 
493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  27.06 
 
 
469 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08340  hexose transport-related protein, putative  29.27 
 
 
550 aa  152  8e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  30.11 
 
 
480 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  29.76 
 
 
485 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  29.21 
 
 
497 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65135  hexose transporter of the major facilitator superfamily  25.91 
 
 
502 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.12142  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  29.91 
 
 
452 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  30.18 
 
 
497 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  28.67 
 
 
468 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02570  receptor, putative  28.51 
 
 
529 aa  150  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.76404  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  30.87 
 
 
494 aa  150  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177873 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06669  Putative sugar transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AYG1]  27.19 
 
 
534 aa  150  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000679135  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02680  glucose transporter, putative  27.9 
 
 
552 aa  150  6e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  28.08 
 
 
467 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  30.2 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  30.2 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  29.91 
 
 
445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  27.65 
 
 
486 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  30.2 
 
 
492 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  27.79 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08737  MSTA protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J220]  27.21 
 
 
527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.187861  normal  0.100961 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05734  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06960)  30.93 
 
 
524 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02585  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05190)  29.44 
 
 
499 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.253437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  27.47 
 
 
466 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  30.43 
 
 
491 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00070  monosaccharide transporter, putative  29.13 
 
 
590 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3240  MFS family transporter: hexose  30.22 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0959044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  25.22 
 
 
475 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03580  hexose transport-related protein, putative  28.79 
 
 
595 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02730  hexose transport-related protein, putative  29.07 
 
 
590 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  27.44 
 
 
482 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06848  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12950)  29.32 
 
 
563 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.817086  normal  0.150124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  28.31 
 
 
474 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  27.62 
 
 
491 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  24.5 
 
 
477 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  28.45 
 
 
491 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03220  receptor, putative  28.57 
 
 
561 aa  145  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  28.44 
 
 
438 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  29.15 
 
 
480 aa  144  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  27.62 
 
 
491 aa  144  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  26.58 
 
 
476 aa  144  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  28.54 
 
 
458 aa  144  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  27.62 
 
 
491 aa  144  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  27.62 
 
 
491 aa  144  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  27.62 
 
 
491 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  27.62 
 
 
491 aa  144  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  27.78 
 
 
485 aa  144  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  27.62 
 
 
491 aa  144  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  30.2 
 
 
490 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  28.45 
 
 
496 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  28.51 
 
 
468 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  29.07 
 
 
468 aa  143  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  28.54 
 
 
459 aa  143  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0824  sugar transporter  32.14 
 
 
456 aa  143  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  28.09 
 
 
464 aa  143  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  28.09 
 
 
464 aa  143  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  28.09 
 
 
464 aa  143  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  28.09 
 
 
464 aa  143  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>