More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_3240 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_3240  MFS family transporter: hexose  100 
 
 
430 aa  850    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0959044 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52000  MFS family transporter: hexose  38.46 
 
 
462 aa  268  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128216  normal  0.0380146 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  35.41 
 
 
480 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  37.98 
 
 
447 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  33.18 
 
 
480 aa  209  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  34.78 
 
 
448 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  32.95 
 
 
477 aa  207  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  33.86 
 
 
458 aa  204  3e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  32.57 
 
 
492 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  32.57 
 
 
450 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  33.64 
 
 
480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  31.64 
 
 
533 aa  201  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  33.78 
 
 
476 aa  200  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  33.26 
 
 
480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  31.43 
 
 
544 aa  196  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  33.64 
 
 
468 aa  196  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  33.11 
 
 
480 aa  195  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  34.16 
 
 
516 aa  196  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  33.55 
 
 
499 aa  195  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  31.65 
 
 
497 aa  193  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  33.77 
 
 
485 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  34.98 
 
 
468 aa  189  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  31.57 
 
 
450 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  31 
 
 
491 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  31 
 
 
491 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  31 
 
 
491 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  31 
 
 
491 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  31 
 
 
491 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  31 
 
 
491 aa  187  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  31.14 
 
 
466 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  33.99 
 
 
486 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  30.77 
 
 
497 aa  187  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  30.85 
 
 
491 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  32.44 
 
 
468 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  32.28 
 
 
473 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  30 
 
 
478 aa  186  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  33.63 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  33.63 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  34.55 
 
 
494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  32.39 
 
 
446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  32.04 
 
 
452 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  32.05 
 
 
465 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  31.83 
 
 
464 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  31.83 
 
 
464 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  31.83 
 
 
464 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  31.83 
 
 
464 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  31.83 
 
 
464 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  32.05 
 
 
464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  30.79 
 
 
457 aa  183  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  32.05 
 
 
464 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  32.05 
 
 
464 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  32.05 
 
 
464 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  32.05 
 
 
464 aa  182  9.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  32.05 
 
 
464 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  32.05 
 
 
464 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  32.05 
 
 
464 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  31.16 
 
 
561 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  32.44 
 
 
468 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  32.39 
 
 
487 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  30.54 
 
 
490 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  31.83 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  32.36 
 
 
473 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  31.26 
 
 
468 aa  180  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  31.36 
 
 
496 aa  179  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  30.44 
 
 
491 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  29.4 
 
 
486 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  31.81 
 
 
474 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  28.76 
 
 
480 aa  177  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  31.26 
 
 
472 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  30.11 
 
 
475 aa  176  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  30.45 
 
 
482 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  31.51 
 
 
442 aa  176  8e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  31.28 
 
 
474 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  30.02 
 
 
449 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  31.07 
 
 
464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  33.41 
 
 
492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  29.55 
 
 
473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  33.41 
 
 
492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  33.41 
 
 
492 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  30.55 
 
 
469 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  31.63 
 
 
468 aa  173  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  33.48 
 
 
479 aa  173  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  30.88 
 
 
441 aa  173  5.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  32.52 
 
 
493 aa  172  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  33.19 
 
 
490 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  28.09 
 
 
477 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  28.86 
 
 
473 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  30.54 
 
 
504 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  30 
 
 
463 aa  170  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  30 
 
 
463 aa  170  5e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  30.7 
 
 
475 aa  169  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  31.49 
 
 
438 aa  169  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  29.2 
 
 
472 aa  169  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  28.6 
 
 
466 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  31.24 
 
 
472 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  31.24 
 
 
472 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  31.01 
 
 
472 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12520  predicted protein  30.97 
 
 
434 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  31.01 
 
 
472 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  30.8 
 
 
475 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>