More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_52000 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_52000  MFS family transporter: hexose  100 
 
 
462 aa  920    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128216  normal  0.0380146 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3240  MFS family transporter: hexose  38.46 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0959044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  33.19 
 
 
533 aa  236  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  34.35 
 
 
477 aa  222  9e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  31.18 
 
 
478 aa  216  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  33.71 
 
 
480 aa  216  7e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  31.65 
 
 
480 aa  203  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  31.71 
 
 
480 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  31.96 
 
 
468 aa  202  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  34 
 
 
447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  31.7 
 
 
493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  31.9 
 
 
486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  32.98 
 
 
485 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  30.46 
 
 
476 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  30.92 
 
 
471 aa  193  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  30.8 
 
 
544 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0133634 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  30.73 
 
 
464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  30.73 
 
 
464 aa  189  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  30.73 
 
 
464 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  30.73 
 
 
464 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  30.73 
 
 
464 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  30.73 
 
 
464 aa  189  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  30.73 
 
 
464 aa  189  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  30.73 
 
 
464 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  32.53 
 
 
474 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  30.73 
 
 
464 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  30 
 
 
490 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  30.89 
 
 
497 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  30.74 
 
 
492 aa  186  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  30.35 
 
 
468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  27.74 
 
 
477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  30.34 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  30.34 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  30.34 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  30.34 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  29.74 
 
 
466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  30.34 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  29.54 
 
 
469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  28.94 
 
 
475 aa  183  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  30.15 
 
 
499 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  32.14 
 
 
487 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  30.72 
 
 
465 aa  183  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  31.51 
 
 
486 aa  182  9.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  29.61 
 
 
480 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  32.65 
 
 
452 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  31.03 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  30.43 
 
 
450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  31.1 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  29.41 
 
 
491 aa  180  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  31 
 
 
463 aa  181  4e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  30.77 
 
 
463 aa  179  9e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  28.57 
 
 
491 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  28.57 
 
 
491 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  28.57 
 
 
491 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  28.57 
 
 
491 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  28.57 
 
 
491 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  28.57 
 
 
491 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  28.57 
 
 
491 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00880  ITR1, putative  31.17 
 
 
567 aa  178  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0105126  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  29.96 
 
 
494 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.177873 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  29.74 
 
 
472 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  30.97 
 
 
472 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  31.33 
 
 
446 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  29.74 
 
 
472 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  29.8 
 
 
448 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  29.35 
 
 
442 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  31.86 
 
 
468 aa  177  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  30.47 
 
 
468 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  29.41 
 
 
472 aa  176  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  30.16 
 
 
450 aa  176  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  29.74 
 
 
472 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  29.74 
 
 
472 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  30.82 
 
 
472 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  29.74 
 
 
472 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  29.74 
 
 
472 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12520  predicted protein  31.43 
 
 
434 aa  175  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94159  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08912  myo-inositol transporter (AFU_orthologue; AFUA_2G07910)  28.03 
 
 
528 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  29.74 
 
 
472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  31.47 
 
 
491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  29.87 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  29.87 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  29.87 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  29.87 
 
 
472 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  31.28 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  31.89 
 
 
457 aa  173  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  29.53 
 
 
472 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  29.65 
 
 
472 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  27.79 
 
 
480 aa  172  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  29.73 
 
 
480 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  30.84 
 
 
464 aa  172  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  29.47 
 
 
491 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  30.72 
 
 
468 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  32.6 
 
 
479 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  29.23 
 
 
480 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0824  sugar transporter  32.81 
 
 
456 aa  170  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  30.11 
 
 
490 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  30.28 
 
 
496 aa  170  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  30.6 
 
 
459 aa  170  6e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  29.53 
 
 
449 aa  170  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  30.44 
 
 
468 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>