More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65135 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_65135  hexose transporter of the major facilitator superfamily  100 
 
 		 502 aa  1029    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.12142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56933  General substrate transporter  36.7 
 
 		 494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.19707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01900  vacuolar membrane protein, putative  26.82 
 
 		 455 aa  161  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.029542  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12520  predicted protein  25.91 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94159  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30620  glucose transport protein  27.64 
 
 		 515 aa  150  5e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  32.19 
 
 		 463 aa  146  9e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  28.85 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  28.84 
 
 		 474 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  32.19 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  28.04 
 
 		 477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  28.57 
 
 		 480 aa  140  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  28.06 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  26.8 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  27.7 
 
 		 533 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  28.32 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  29.31 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  29.48 
 
 		 468 aa  136  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  25.81 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  26.91 
 
 		 480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  28.54 
 
 		 516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2136  sugar transporter  29.02 
 
 		 447 aa  134  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  25.47 
 
 		 464 aa  133  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  26.7 
 
 		 473 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  27.15 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  26.33 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  26.46 
 
 		 473 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  27.72 
 
 		 444 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  25.78 
 
 		 471 aa  130  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  26.79 
 
 		 476 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  26.33 
 
 		 438 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  26.7 
 
 		 472 aa  128  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  26.7 
 
 		 472 aa  128  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  26.7 
 
 		 472 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  26.7 
 
 		 472 aa  127  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  26.7 
 
 		 472 aa  128  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  26.7 
 
 		 472 aa  128  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  26.7 
 
 		 472 aa  128  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  27.92 
 
 		 448 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  28.28 
 
 		 492 aa  127  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  26.84 
 
 		 464 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  26.84 
 
 		 464 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  26.84 
 
 		 464 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  26.84 
 
 		 464 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  26.84 
 
 		 464 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  26.46 
 
 		 472 aa  126  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  26.84 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  26.84 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  26.84 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  26.84 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  26.84 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  26.84 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  26.84 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  26.46 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  25.9 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  26.46 
 
 		 472 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  26.46 
 
 		 472 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  26.46 
 
 		 472 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  26.46 
 
 		 472 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  26.84 
 
 		 464 aa  125  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  27.34 
 
 		 465 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  25.53 
 
 		 473 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  26.58 
 
 		 464 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00070  monosaccharide transporter, putative  25.41 
 
 		 590 aa  123  6e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  24.85 
 
 		 491 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  24.85 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  24.85 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  24.85 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  24.85 
 
 		 491 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  24.85 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  24.85 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03580  hexose transport-related protein, putative  26.1 
 
 		 595 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  25.48 
 
 		 452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  28.12 
 
 		 480 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  25.83 
 
 		 472 aa  120  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  27.56 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1619  hypothetical protein  26.59 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41151  MFS family transporter: sugar  28.18 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  27.11 
 
 		 452 aa  118  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  25.34 
 
 		 445 aa  118  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  27.11 
 
 		 452 aa  118  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  26.23 
 
 		 473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02730  hexose transport-related protein, putative  25.58 
 
 		 590 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  26.4 
 
 		 561 aa  116  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  25 
 
 		 471 aa  116  8.999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  27.59 
 
 		 484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0824  sugar transporter  27.84 
 
 		 456 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  24.71 
 
 		 491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03090  sugar transporter, putative  27.16 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  27.55 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  22.81 
 
 		 457 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  25.07 
 
 		 499 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  27.99 
 
 		 449 aa  114  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01480  hexose transport-related protein, putative  25 
 
 		 520 aa  114  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1624  hypothetical protein  26.59 
 
 		 471 aa  114  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  27.62 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  26.17 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  26.27 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  27.7 
 
 		 457 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05734  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06960)  25.49 
 
 		 524 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_1870  TRD4  26.61 
 
 		 467 aa  110  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>