More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_56933 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_56933  General substrate transporter  100 
 
 		 494 aa  990    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.19707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65135  hexose transporter of the major facilitator superfamily  36.7 
 
 		 502 aa  337  1.9999999999999998e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.12142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  31.46 
 
 		 533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12520  predicted protein  28.85 
 
 		 434 aa  180  7e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94159  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  31.24 
 
 		 477 aa  179  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  29.2 
 
 		 480 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52000  MFS family transporter: hexose  28.48 
 
 		 462 aa  166  8e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128216  normal  0.0380146 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  29.56 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  29.84 
 
 		 492 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  27.03 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  27.35 
 
 		 442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  28.45 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  28.51 
 
 		 458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01900  vacuolar membrane protein, putative  26.27 
 
 		 455 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.029542  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  27.78 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  25 
 
 		 475 aa  144  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  25.97 
 
 		 480 aa  144  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  27.46 
 
 		 463 aa  143  8e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  26.64 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  27.43 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  26.25 
 
 		 499 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  27.77 
 
 		 544 aa  140  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  25.2 
 
 		 467 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  27.08 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3240  MFS family transporter: hexose  26.71 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0959044 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  26.7 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  27.48 
 
 		 444 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02730  hexose transport-related protein, putative  25.53 
 
 		 590 aa  138  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  27 
 
 		 463 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03090  sugar transporter, putative  24.95 
 
 		 579 aa  137  4e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  27.93 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  25.84 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  25.43 
 
 		 480 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  25.3 
 
 		 466 aa  134  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  25.64 
 
 		 478 aa  134  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  26.17 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  23.34 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  25.63 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  26.13 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  25.89 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  24.85 
 
 		 480 aa  131  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05104  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07700)  28.01 
 
 		 576 aa  130  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0144049  hitchhiker  0.00149978 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30620  glucose transport protein  26.65 
 
 		 515 aa  129  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  27.13 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  25.58 
 
 		 474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  26.91 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03580  hexose transport-related protein, putative  23.82 
 
 		 595 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  25.9 
 
 		 477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  26.04 
 
 		 480 aa  128  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  27.44 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  27.21 
 
 		 476 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05323  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06870)  25.06 
 
 		 662 aa  127  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  27.25 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  25 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  28.18 
 
 		 507 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04310  monosaccharide transporter, putative  25.15 
 
 		 591 aa  125  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33008  sugar transporter, high affinity, putative  29.91 
 
 		 566 aa  125  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.348655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  25.62 
 
 		 473 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  24 
 
 		 485 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  24.39 
 
 		 484 aa  124  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  25.41 
 
 		 473 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  25.41 
 
 		 480 aa  123  6e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  25.86 
 
 		 504 aa  123  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  26.47 
 
 		 486 aa  123  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  25 
 
 		 497 aa  123  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  25.46 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  25.29 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47769  predicted protein  24.88 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  24.4 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00540  galactose transporter, putative  25.89 
 
 		 550 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  26.53 
 
 		 493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9947  predicted protein  26.09 
 
 		 439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  24.77 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80454  myo-inositol transporter  25.17 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.806803  normal  0.231524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  24.16 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03220  receptor, putative  25.12 
 
 		 561 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  24.55 
 
 		 491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  26.12 
 
 		 472 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  24.33 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  24.33 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  24.33 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  24.33 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  24.33 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  25.9 
 
 		 479 aa  118  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  25.97 
 
 		 470 aa  118  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  24.33 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01480  hexose transport-related protein, putative  25 
 
 		 520 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_16856  high affinity xylose transporter (putative) (HGT3)  24.94 
 
 		 529 aa  116  7.999999999999999e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0752816  normal  0.401981 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  25.83 
 
 		 464 aa  116  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  25.83 
 
 		 464 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  25.83 
 
 		 464 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  25.83 
 
 		 464 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  25.83 
 
 		 464 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  25.83 
 
 		 464 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  25.83 
 
 		 464 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  25.83 
 
 		 464 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06669  Putative sugar transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AYG1]  24.82 
 
 		 534 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000679135  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23260  predicted protein  25.61 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  25.28 
 
 		 474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  25.83 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>