More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0105 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0368  DNA topoisomerase IV subunit B  56.54 
 
 		 644 aa  752    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.550599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2567  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain protein  62.8 
 
 		 632 aa  793    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0648  DNA topoisomerase IV subunit B  63.4 
 
 		 626 aa  835    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3105  DNA topoisomerase IV subunit B  63.61 
 
 		 640 aa  809    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2083  DNA topoisomerase IV subunit B  64.14 
 
 		 616 aa  822    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173005  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1194  DNA topoisomerase IV subunit B  63.11 
 
 		 613 aa  798    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000381056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3475  DNA topoisomerase IV subunit B  64.04 
 
 		 633 aa  827    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2768  DNA topoisomerase IV subunit B  64.43 
 
 		 623 aa  828    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.773452 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09718  DNA topoisomerase IV subunit B  63.11 
 
 		 618 aa  808    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.444196  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1614  DNA topoisomerase IV subunit B  66.72 
 
 		 628 aa  855    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218191  normal  0.0551388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0105  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 629 aa  1291    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2473  DNA topoisomerase IV subunit B  62.58 
 
 		 622 aa  804    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2245  DNA topoisomerase IV subunit B  52.29 
 
 		 605 aa  634  1e-180  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.805045  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0036  DNA topoisomerase IV subunit B  50.91 
 
 		 599 aa  606  9.999999999999999e-173  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0032  DNA topoisomerase IV subunit B  47.6 
 
 		 605 aa  566  1e-160  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  33.89 
 
 		 654 aa  334  3e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  32.47 
 
 		 651 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  32.58 
 
 		 652 aa  320  6e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  32.67 
 
 		 645 aa  319  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  33.94 
 
 		 652 aa  313  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  33.59 
 
 		 650 aa  311  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  33.08 
 
 		 646 aa  311  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  32.88 
 
 		 651 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  33.02 
 
 		 636 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  32.11 
 
 		 640 aa  304  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  32.97 
 
 		 633 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  32.87 
 
 		 636 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  31.87 
 
 		 658 aa  303  8.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  35.39 
 
 		 635 aa  302  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  32.82 
 
 		 637 aa  301  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  31.86 
 
 		 665 aa  300  4e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  31.59 
 
 		 659 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  34.52 
 
 		 640 aa  299  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  32.98 
 
 		 644 aa  296  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  32.62 
 
 		 637 aa  295  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  32.06 
 
 		 649 aa  294  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  33.02 
 
 		 643 aa  293  4e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  31.26 
 
 		 638 aa  293  5e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2996  DNA gyrase, B subunit  31.62 
 
 		 666 aa  293  6e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  31.73 
 
 		 644 aa  293  8e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  32.46 
 
 		 644 aa  293  9e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  33.96 
 
 		 633 aa  292  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  32.56 
 
 		 643 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  32.09 
 
 		 637 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  33.75 
 
 		 628 aa  289  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  31.42 
 
 		 636 aa  288  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  33.58 
 
 		 656 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  31.85 
 
 		 633 aa  287  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  31.15 
 
 		 644 aa  286  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  33.79 
 
 		 644 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  31.29 
 
 		 675 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  31.24 
 
 		 637 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  30.33 
 
 		 645 aa  283  5.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0003  DNA gyrase subunit B  33.39 
 
 		 772 aa  283  7.000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  31.96 
 
 		 647 aa  282  1e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  33.81 
 
 		 627 aa  281  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  32.21 
 
 		 649 aa  281  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  32.45 
 
 		 644 aa  280  4e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  32.18 
 
 		 638 aa  280  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  32.49 
 
 		 647 aa  280  7e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  32.67 
 
 		 652 aa  280  8e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  32.67 
 
 		 645 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  31.89 
 
 		 653 aa  279  9e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  31.78 
 
 		 645 aa  279  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  31.86 
 
 		 645 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  32.67 
 
 		 633 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1622  DNA gyrase, B subunit  34.74 
 
 		 786 aa  276  9e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  31.68 
 
 		 648 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0964  DNA gyrase, B subunit  33.1 
 
 		 812 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.780109  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2867  DNA topoisomerase IV subunit B  33.33 
 
 		 707 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.018602 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  33 
 
 		 769 aa  274  4.0000000000000004e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  31.23 
 
 		 648 aa  274  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  31.2 
 
 		 634 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  33.13 
 
 		 647 aa  273  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  31.78 
 
 		 804 aa  273  7e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  32.6 
 
 		 635 aa  273  7e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  30.36 
 
 		 632 aa  273  7e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  31.6 
 
 		 643 aa  273  8.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  31.68 
 
 		 640 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  30.84 
 
 		 653 aa  273  8.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  31.95 
 
 		 640 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  32.18 
 
 		 634 aa  273  9e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  32.83 
 
 		 654 aa  273  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  32.08 
 
 		 651 aa  272  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0523  DNA topoisomerase IV subunit B  29.91 
 
 		 642 aa  272  1e-71  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0005  DNA gyrase, B subunit  33.23 
 
 		 647 aa  272  1e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  33 
 
 		 769 aa  272  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  31.11 
 
 		 635 aa  271  2e-71  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  32.15 
 
 		 640 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0003  DNA gyrase subunit B  34.51 
 
 		 797 aa  272  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561355  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  31.59 
 
 		 642 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  31.99 
 
 		 640 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  30.15 
 
 		 661 aa  271  2e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  31.56 
 
 		 642 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2927  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  30.85 
 
 		 643 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  31.03 
 
 		 675 aa  271  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  31.72 
 
 		 641 aa  271  4e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  31.85 
 
 		 642 aa  271  4e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  31.71 
 
 		 636 aa  270  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  31.03 
 
 		 675 aa  271  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>