More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0036 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2245  DNA topoisomerase IV subunit B  62.42 
 
 
605 aa  729    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.805045  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0036  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 
599 aa  1203    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0032  DNA topoisomerase IV subunit B  52.66 
 
 
605 aa  632  1e-180  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0105  DNA topoisomerase IV subunit B  50.91 
 
 
629 aa  628  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0648  DNA topoisomerase IV subunit B  50.99 
 
 
626 aa  614  9.999999999999999e-175  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2768  DNA topoisomerase IV subunit B  50.83 
 
 
623 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.773452 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3475  DNA topoisomerase IV subunit B  50.17 
 
 
633 aa  596  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2083  DNA topoisomerase IV subunit B  49.51 
 
 
616 aa  596  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.173005  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1614  DNA topoisomerase IV subunit B  50.58 
 
 
628 aa  595  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218191  normal  0.0551388 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09718  DNA topoisomerase IV subunit B  50.99 
 
 
618 aa  591  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.444196  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1194  DNA topoisomerase IV subunit B  49.34 
 
 
613 aa  582  1.0000000000000001e-165  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000381056  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2567  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain protein  49.26 
 
 
632 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3105  DNA topoisomerase IV subunit B  50.82 
 
 
640 aa  581  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2473  DNA topoisomerase IV subunit B  48.37 
 
 
622 aa  572  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0368  DNA topoisomerase IV subunit B  47.78 
 
 
644 aa  564  1.0000000000000001e-159  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.550599 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  34.98 
 
 
652 aa  342  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  34.17 
 
 
644 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  36.16 
 
 
650 aa  336  7e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  34.5 
 
 
628 aa  336  7e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  34.77 
 
 
651 aa  333  8e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  35.25 
 
 
654 aa  330  3e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  34.12 
 
 
636 aa  330  3e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  34.8 
 
 
640 aa  330  5.0000000000000004e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  33.96 
 
 
636 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  34.49 
 
 
633 aa  327  5e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  34.26 
 
 
648 aa  326  8.000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  34.16 
 
 
659 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  34.42 
 
 
635 aa  323  7e-87  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  35.08 
 
 
635 aa  322  9.999999999999999e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  33.08 
 
 
646 aa  321  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  34.17 
 
 
633 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  33.44 
 
 
637 aa  321  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  34.06 
 
 
645 aa  320  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  34.72 
 
 
660 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  34.02 
 
 
637 aa  320  5e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  35.44 
 
 
642 aa  320  5e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  34.34 
 
 
634 aa  320  7e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  34.86 
 
 
643 aa  319  9e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  35.25 
 
 
642 aa  318  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  34.49 
 
 
643 aa  318  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  35.56 
 
 
627 aa  317  4e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  33.69 
 
 
648 aa  317  4e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  35.71 
 
 
633 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  34.02 
 
 
649 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  33.44 
 
 
632 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0003  DNA gyrase subunit B  35.42 
 
 
772 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  33.75 
 
 
637 aa  313  4.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  33.59 
 
 
661 aa  312  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  33.28 
 
 
654 aa  311  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  32.82 
 
 
649 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  34.71 
 
 
651 aa  310  6.999999999999999e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  33.91 
 
 
634 aa  309  8e-83  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  34.87 
 
 
638 aa  309  8e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  34.12 
 
 
642 aa  309  9e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  31.8 
 
 
636 aa  309  9e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  33.13 
 
 
652 aa  309  9e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  35.28 
 
 
638 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  35.3 
 
 
642 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  34.52 
 
 
769 aa  307  3e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  32.91 
 
 
636 aa  307  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  32.97 
 
 
651 aa  308  3e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  35.12 
 
 
638 aa  308  3e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  34.7 
 
 
641 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  34.54 
 
 
644 aa  306  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  34.05 
 
 
650 aa  306  7e-82  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  32.5 
 
 
654 aa  306  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  33.97 
 
 
640 aa  306  9.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  32.86 
 
 
637 aa  306  9.000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  34.35 
 
 
769 aa  306  9.000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  33.91 
 
 
640 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  32.34 
 
 
654 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  33.91 
 
 
640 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  34.22 
 
 
640 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  32.97 
 
 
674 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  34.51 
 
 
655 aa  306  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  33.91 
 
 
640 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  33.91 
 
 
640 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  32.34 
 
 
654 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  33.91 
 
 
640 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2996  DNA gyrase, B subunit  33.18 
 
 
666 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39538  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  32.55 
 
 
656 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  33.75 
 
 
640 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  32.34 
 
 
654 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  32.34 
 
 
654 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  32.34 
 
 
654 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  32.34 
 
 
654 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  32.34 
 
 
654 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  33.39 
 
 
647 aa  304  3.0000000000000004e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  32.66 
 
 
654 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  33.97 
 
 
636 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  34.02 
 
 
644 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  33.49 
 
 
644 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  33.6 
 
 
633 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0003  DNA gyrase subunit B  34.01 
 
 
769 aa  303  5.000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  34.38 
 
 
638 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  34.07 
 
 
640 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  33.91 
 
 
640 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  32.44 
 
 
645 aa  303  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl309  DNA topoisomerase IV subunit B  33.86 
 
 
647 aa  302  1e-80  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.747062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  32.5 
 
 
654 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>