191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0417 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0417  citrate lyase regulator  100 
 
 		 319 aa  647    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  31.27 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  22.15 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2251  DeoR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 320 aa  99  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0678126  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  24.6 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  23.47 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1988  transcriptional regulator, DeoR family  25.17 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000190118 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3997  transcriptional regulator, DeoR family  23.03 
 
 		 312 aa  95.9  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  23.15 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1869  transcriptional regulator, DeoR family  21.6 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  24.61 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  24.67 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  24.92 
 
 		 319 aa  89  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  22.12 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 333 aa  85.9  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  22.65 
 
 		 333 aa  85.9  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  25.64 
 
 		 327 aa  85.9  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  21.9 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0561  transcriptional regulator, DeoR family  22.26 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  23.69 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  24.69 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  24.69 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5885  DeoR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  24.69 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  22.83 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  22.8 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4826  DeoR family transcriptional regulator  20.6 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.658414  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  22.8 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0304  transcriptional regulator, DeoR family  21.82 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  22.92 
 
 		 700 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  21.09 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  21.71 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06830  transcriptional regulator  21.12 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2790  DeoR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2834  DeoR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2817  DeoR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0275474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0488  transcriptional regulator, DeoR family  21.59 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  23.75 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  23.75 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  22.88 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  22.52 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  23.17 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  20.74 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  20.74 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  21.7 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  20.74 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  20.74 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  20.74 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  20.74 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  20.74 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1900  transcriptional regulator, DeoR family protein  23.77 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481716  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  23 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  23 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  21.4 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  20.71 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  22.37 
 
 		 694 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2797  transcriptional regulator, DeoR family  22.04 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  20.2 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  22.43 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  21.07 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0522  transcriptional regulator  20.06 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  21.94 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  20.74 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  20.74 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  22.15 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  22.71 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  20.66 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  20.81 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  21.67 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  20.74 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  22.12 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  22.12 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  20.74 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  20.74 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  21.36 
 
 		 694 aa  70.5  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  20.13 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  24.29 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3288  transcriptional regulator, DeoR family  21.81 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal  0.0190392 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  22.53 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  23.01 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  23.01 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  23.01 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  23.01 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  23.01 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  21.81 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.853311 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>