203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2817 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2790  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
306 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2834  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
306 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2817  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
306 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0275474  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1461  transcriptional regulator, DeoR family  43.71 
 
 
318 aa  251  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2797  transcriptional regulator, DeoR family  42.9 
 
 
315 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3997  transcriptional regulator, DeoR family  41.91 
 
 
312 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0304  transcriptional regulator, DeoR family  40.14 
 
 
324 aa  192  7e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3263  DeoR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
321 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1639  DeoR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
325 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294849  hitchhiker  0.00400864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0573  transcriptional regulator, DeoR family  36.42 
 
 
312 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  30.94 
 
 
323 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  30.57 
 
 
339 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  30.57 
 
 
339 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  30.57 
 
 
339 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  30.57 
 
 
339 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  30.57 
 
 
339 aa  126  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  30.57 
 
 
339 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  30.57 
 
 
339 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  27.21 
 
 
321 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29950  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  31.7 
 
 
319 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4174  DeoR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
310 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
357 aa  115  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
339 aa  112  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  29.97 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  29.97 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  29.97 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
322 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  30.52 
 
 
318 aa  109  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
326 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  29.77 
 
 
325 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06830  transcriptional regulator  31.85 
 
 
320 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  29.26 
 
 
334 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
320 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  29.77 
 
 
325 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  28.57 
 
 
337 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  28.85 
 
 
332 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  28.2 
 
 
320 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  22.58 
 
 
313 aa  106  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  23.96 
 
 
316 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  26.69 
 
 
321 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
333 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0488  transcriptional regulator, DeoR family  31.42 
 
 
317 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2088  transcriptional regulator, DeoR family  33.22 
 
 
315 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
335 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  27.39 
 
 
327 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  28.52 
 
 
321 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2251  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
320 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0678126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
363 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
326 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2217  sugar-binding domain-containing protein  31.96 
 
 
318 aa  103  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0880863 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1923  DeoR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
318 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
317 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1813  sugar-binding domain-containing protein  31.96 
 
 
318 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  27.06 
 
 
326 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
334 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.83 
 
 
315 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  28.24 
 
 
310 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  30.79 
 
 
694 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.5 
 
 
315 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  25.5 
 
 
315 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  25 
 
 
315 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.5 
 
 
315 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.5 
 
 
315 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  28.28 
 
 
338 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  26.73 
 
 
333 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.5 
 
 
316 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  25.5 
 
 
315 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  28.71 
 
 
321 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1988  transcriptional regulator, DeoR family  28.38 
 
 
324 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000190118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0561  transcriptional regulator, DeoR family  29 
 
 
322 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2127  putative transcriptional regulator (repressor) transcription regulator protein  32.24 
 
 
315 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  27.63 
 
 
331 aa  99.4  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  27.87 
 
 
333 aa  99  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  29.43 
 
 
694 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  26.95 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  30.26 
 
 
700 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  25.17 
 
 
315 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
315 aa  97.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0710  DeoR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
335 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0415966  normal  0.409033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  28.52 
 
 
325 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  21.52 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3753  transcriptional regulator, DeoR family  25.34 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188827  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  25.41 
 
 
326 aa  95.9  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  23.33 
 
 
315 aa  95.9  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  26.03 
 
 
316 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
315 aa  95.5  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0496  DeoR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
322 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.858474  hitchhiker  0.000586642 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  31.42 
 
 
695 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2611  DeoR family transcriptional regulator  31.42 
 
 
337 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.682873  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0090  operon regulator SmoC  25.5 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0568695  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1977  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
337 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2587  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
337 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2506  DeoR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
345 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140537  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2635  DeoR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
340 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>