225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3131 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 316 aa  636    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  76.11 
 
 		 316 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  75.16 
 
 		 316 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  41.77 
 
 		 314 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  41.77 
 
 		 314 aa  245  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  42.09 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  42.17 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3426  transcriptional regulator, DeoR family  37.78 
 
 		 336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  37.82 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3422  transcriptional regulator, DeoR family  35.85 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00167672  hitchhiker  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  30.82 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  33.87 
 
 		 315 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  33.55 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.55 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.55 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.55 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  33.55 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.55 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.55 
 
 		 316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  33.55 
 
 		 315 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  30.89 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  28.71 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  29.06 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  28.06 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  28.98 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  34.24 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  30.55 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  32.01 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 363 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  29.21 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  28.89 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  30.72 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  30.72 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  29.45 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000852212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  28.89 
 
 		 310 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  28.89 
 
 		 310 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  28.89 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  32.68 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  32.68 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  32.68 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  32.68 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  32.68 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  32.68 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  32.68 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  26.84 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  30.03 
 
 		 321 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  23.15 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  30.77 
 
 		 694 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  28.2 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  31.67 
 
 		 694 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  29.13 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 333 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  29.68 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  28.67 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 320 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  29.68 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  29.18 
 
 		 326 aa  112  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  27.3 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  27.3 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  26.99 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3997  transcriptional regulator, DeoR family  28.85 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  28.09 
 
 		 700 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  28.53 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  31.25 
 
 		 695 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  25.32 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  30.45 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  26.64 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  26.64 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  26.95 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  28.75 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  28.24 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>