224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0453 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1816  putative sugar-binding protein  99.41 
 
 
339 aa  685    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129993  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1790  PTS system, mannitol-specific IIBC component  99.41 
 
 
339 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0814  putative sugar-binding protein  99.41 
 
 
339 aa  685    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1105  putative sugar-binding protein  99.41 
 
 
339 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0453  DNA-binding protein  100 
 
 
339 aa  689    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0358  putative transcriptional regulator  99.71 
 
 
339 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2078  putative sugar-binding protein  99.41 
 
 
339 aa  685    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0409  DeoR family transcriptional regulator  69.18 
 
 
339 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.490388 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2041  DeoR family transcriptional regulator  66.98 
 
 
333 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.753414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4578  DeoR family transcriptional regulator  69.03 
 
 
318 aa  428  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684282  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  64.4 
 
 
363 aa  411  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  62.1 
 
 
326 aa  408  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  62.62 
 
 
310 aa  398  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2573  putative sugar-binding region  59.46 
 
 
337 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0455  HTH-type transcriptional regulator  54.11 
 
 
326 aa  354  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3417  DeoR family transcriptional regulator  52.73 
 
 
323 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0947  sugar-binding domain-containing protein  52.73 
 
 
323 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3284  sugar-binding domain-containing protein  52.73 
 
 
319 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0989  transcriptional regulator, DeoR family  52.68 
 
 
321 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0753  transcriptional regulator, DeoR family  52.05 
 
 
332 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245916  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  51.27 
 
 
331 aa  334  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2156  transcriptional regulator, DeoR family  50.79 
 
 
320 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0087  transcriptional regulator  50.64 
 
 
326 aa  325  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.284033  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  50.98 
 
 
333 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  50 
 
 
333 aa  320  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  31.73 
 
 
321 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  30.97 
 
 
323 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
307 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 
319 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  32.48 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  32.67 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  28.3 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  25.32 
 
 
315 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3075  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
335 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
342 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  27.74 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000852212  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  30.03 
 
 
345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  31.21 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5157  transcriptional regulator, DeoR family  28.75 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3606  DeoR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
334 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2790  DeoR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
306 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  28.21 
 
 
321 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2834  DeoR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
306 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2817  DeoR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
306 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0275474  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  28.89 
 
 
324 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
316 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  30.52 
 
 
321 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
320 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  30.23 
 
 
315 aa  122  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0090  operon regulator SmoC  31.79 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0568695  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  26.6 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3043  DeoR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  31.72 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  30.03 
 
 
325 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  30.23 
 
 
315 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  31.95 
 
 
316 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  30.23 
 
 
315 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  30.03 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  29.93 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1726  DeoR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  29.93 
 
 
316 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
312 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  26.98 
 
 
327 aa  116  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  27.21 
 
 
313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  29.28 
 
 
313 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  29.08 
 
 
315 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  29.28 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  29.28 
 
 
362 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
357 aa  113  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2858  DeoR family transcriptional regulator  29.04 
 
 
310 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.427449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  29.5 
 
 
319 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  29.5 
 
 
319 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  29.5 
 
 
319 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  29.5 
 
 
319 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 
310 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  28.84 
 
 
317 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.853311 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  28.84 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  29.18 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  28.76 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  27.15 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  30.41 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  29.19 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  28.84 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  28.84 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  28.52 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  28.84 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  28.95 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  28.84 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  26.61 
 
 
328 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  28.2 
 
 
325 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  29.63 
 
 
695 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
310 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  28.43 
 
 
694 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  26.45 
 
 
308 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0643  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
330 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1190  DeoR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
326 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11475  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  31.82 
 
 
318 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.06 
 
 
315 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>