223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1974 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  100 
 
 
315 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  98.73 
 
 
315 aa  639    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  98.73 
 
 
315 aa  639    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  98.73 
 
 
315 aa  639    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  98.41 
 
 
315 aa  635    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  98.73 
 
 
315 aa  639    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  98.09 
 
 
315 aa  634    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  98.73 
 
 
315 aa  639    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  99.04 
 
 
316 aa  639    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  97.14 
 
 
315 aa  632  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  91.72 
 
 
315 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
310 aa  293  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  31.29 
 
 
315 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  34.5 
 
 
317 aa  178  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3288  transcriptional regulator, DeoR family  33.75 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.112061  normal  0.0190392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2251  DeoR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0678126  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2524  DeoR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
357 aa  172  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0561  transcriptional regulator, DeoR family  30.25 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
317 aa  165  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  33.88 
 
 
316 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1988  transcriptional regulator, DeoR family  31.15 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000190118 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06830  transcriptional regulator  30.99 
 
 
320 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  32.49 
 
 
321 aa  159  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1869  transcriptional regulator, DeoR family  30.63 
 
 
335 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.273722  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
334 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
316 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  32.57 
 
 
316 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29950  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  30.72 
 
 
319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  33.02 
 
 
316 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  31.65 
 
 
327 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4358  DeoR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
339 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4444  DeoR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
339 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0599387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4738  DeoR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
339 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  29.87 
 
 
308 aa  149  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 
323 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  29.79 
 
 
328 aa  148  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  32.59 
 
 
319 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  30.42 
 
 
313 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  31.53 
 
 
315 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  31.53 
 
 
315 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  31.21 
 
 
315 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0488  transcriptional regulator, DeoR family  29.71 
 
 
317 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
326 aa  133  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  31.27 
 
 
700 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  31.05 
 
 
694 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  29.17 
 
 
314 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  29.17 
 
 
314 aa  129  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
314 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  30.35 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  31.11 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  28.21 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
310 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
341 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0522  transcriptional regulator  27.71 
 
 
319 aa  125  8.000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  27.83 
 
 
310 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  27.36 
 
 
310 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
339 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03820  transcriptional regulator with sigma factor-related N-terminal domain  27.71 
 
 
318 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 
310 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  27.1 
 
 
316 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3426  transcriptional regulator, DeoR family  28.9 
 
 
336 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000128102  hitchhiker  0.000369774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 
310 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2088  transcriptional regulator, DeoR family  31.92 
 
 
315 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  31.6 
 
 
694 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  27.04 
 
 
310 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  27.04 
 
 
315 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1160  citrate lyase regulator, putative  28.29 
 
 
321 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  26.71 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  26.71 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
322 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
320 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  25.48 
 
 
338 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  25.88 
 
 
324 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  27.9 
 
 
320 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2553  DeoR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
342 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2598  DeoR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
342 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0969479  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2592  DeoR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
342 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641807  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  26.9 
 
 
321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  26.77 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  27.18 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3725  transcriptional regulator, DeoR family  28.39 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000852212  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  27.1 
 
 
325 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06255  deoxyribonucleoside regulator/dihydroxyacetone kinase  26.9 
 
 
333 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3753  transcriptional regulator, DeoR family  29 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188827  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000492  transcriptional regulator  26.9 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2359  DeoR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711472  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0563  SorC family transcriptional regulator  26.84 
 
 
331 aa  109  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  26.62 
 
 
317 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02313  putative transcriptional regulator  27.12 
 
 
318 aa  108  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00764074  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3451  transcriptional regulator, DeoR family  28.67 
 
 
316 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
317 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  26.62 
 
 
317 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
312 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  26.62 
 
 
317 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3563  hypothetical protein  29.51 
 
 
317 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  26.62 
 
 
317 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  25.49 
 
 
334 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>