223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2773 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2773  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
310 aa  638    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0783216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2767  transcriptional regulator  89.35 
 
 
362 aa  570  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.872952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2976  putative transcriptional regulator  89.35 
 
 
310 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000216017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2979  transcriptional regulator  89.35 
 
 
313 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2262  putative transcriptional regulator  88.06 
 
 
316 aa  570  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3016  transcriptional regulator, putative  88.06 
 
 
310 aa  568  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.241411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2717  deoxyribonucleoside regulator  88.39 
 
 
310 aa  567  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2697  deoxyribonucleoside regulator  88.71 
 
 
310 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3018  deoxyribonucleoside regulator  88.39 
 
 
315 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2980  putative transcriptional regulator  88.39 
 
 
310 aa  569  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3505  DeoR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3150  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2125  transcriptional repressor LsrR  38.16 
 
 
317 aa  193  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1594  transcriptional repressor LsrR  38.16 
 
 
317 aa  193  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2146  DeoR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
317 aa  193  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1660  transcriptional repressor LsrR  38.16 
 
 
317 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.853311 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2134  transcriptional regulator, DeoR family  38.16 
 
 
317 aa  192  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10334  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1713  transcriptional repressor LsrR  38.16 
 
 
317 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3537  DeoR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3519  Crp/Fnr family sugar-binding transcriptional regulatory  36.63 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3649  DeoR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
331 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4319  putative sugar-binding domain protein  34.88 
 
 
319 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4404  putative sugar-binding domain-containing protein  34.88 
 
 
319 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.25988  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4471  hypothetical protein  34.88 
 
 
319 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4289  putative sugar-binding domain protein  34.88 
 
 
319 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.103227  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4401  putative sugar-binding domain protein  34.88 
 
 
319 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0050  sorbitol operon transcriptional regulator  34.94 
 
 
319 aa  172  7.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00407862  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0686  transcriptional regulator, DeoR family  32.8 
 
 
317 aa  169  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000719741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4103  transcriptional regulator, DeoR family  33.76 
 
 
313 aa  168  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000227341  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1069  transcriptional regulator, DeoR family  33.02 
 
 
316 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000512012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0812  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 
320 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.336139 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0255  DeoR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
320 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.991369  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0407  transcriptional regulator, putative  29.77 
 
 
321 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  30.91 
 
 
694 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3767  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 
321 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  30.16 
 
 
700 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2165  DeoR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2702  DeoR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2010  DeoR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1126  DeoR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
307 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4114  DeoR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
339 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  30.16 
 
 
694 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1990  transcriptional regulator, DeoR family  30.48 
 
 
319 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.356638  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2565  DeoR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
336 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2414  DeoR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
333 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415693  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5326  transcriptional regulator, DeoR family  29.03 
 
 
311 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.625003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2312  sugar-binding domain-containing protein  27.92 
 
 
333 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2232  DeoR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2050  transcriptional regulator, DeoR family  29.08 
 
 
323 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2908  DeoR family transcriptional regulator  28.62 
 
 
316 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1071  transcriptional regulator, DeoR family  28.53 
 
 
308 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0743327  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2030  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 
316 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130685  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  29.02 
 
 
695 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2252  transcriptional regulator, DeoR family  30.72 
 
 
316 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345657  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1661  DeoR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
345 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3131  DeoR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
316 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1468  DeoR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010557  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0867  erythritol transcriptional regulator  28.16 
 
 
316 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0904  sugar-binding domain-containing protein  30.65 
 
 
314 aa  132  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3245  sugar-binding domain-containing protein  30.65 
 
 
314 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3378  DeoR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2685  DeoR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3452  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.83 
 
 
315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224195  hitchhiker  1.06699e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3224  putative transcription regulator  27.36 
 
 
338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739516  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1702  deoxyribonucleoside regulator  27.96 
 
 
315 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000147991  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2395  transcriptional regulator, putative  31.55 
 
 
317 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.129773  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4059  DeoR family transcriptional regulator  28.34 
 
 
326 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.810419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1926  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.96 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.60106e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1750  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00345901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1753  deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.96 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000750924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1731  deoxyribonucleoside regulator  27.96 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000228989  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6263  transcriptional regulator, DeoR family  26.06 
 
 
334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390293 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1891  deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.96 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2001  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.96 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000544844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1894  putative deoxyribonucleoside regulator DeoR  27.83 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0693832  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0115  DeoR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
310 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1974  deoxyribonucleoside regulator DeoR, putative  27.69 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00373249  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1366  DeoR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4003  transcriptional regulator, DeoR family  25.65 
 
 
319 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3438  transcriptional regulator, DeoR family  25.57 
 
 
325 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0327  transcriptional regulator, putative  28.62 
 
 
327 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0532  transcriptional regulator  28.94 
 
 
324 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3737  transcriptional regulator, DeoR family  25.57 
 
 
325 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2643  transcriptional regulator, DeoR family  29.13 
 
 
314 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000047791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5499  sorbitol operon regulator SorC  28.99 
 
 
315 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0632  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
318 aa  122  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289497  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4482  sorbitol operon regulator SorC  28.99 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.543234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4524  sorbitol operon regulator SorC  28.99 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0358  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
326 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0522  transcriptional regulator  27.67 
 
 
319 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3849  transcriptional regulator  25.57 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0409  DeoR family transcriptional regulator  28.48 
 
 
334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717665  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1034  transcriptional regulator, DeoR family  25.8 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000316866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3705  transcriptional regulator, DeoR family  25.08 
 
 
328 aa  119  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22170  sugar-binding domain-containing protein  28.21 
 
 
310 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0550  transcriptional regulator  25.24 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1339  DeoR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
363 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1720  DeoR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.925466  normal  0.0186791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3776  DeoR family transcriptional regulator  28.2 
 
 
313 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4174  DeoR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
310 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>